36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3181 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  100 
 
 		 580 aa  1192    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  51.57 
 
 		 595 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  54.29 
 
 		 575 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  52.99 
 
 		 568 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  48.7 
 
 		 602 aa  535  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  46.15 
 
 		 624 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  32.76 
 
 		 602 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  31.88 
 
 		 580 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  29.13 
 
 		 551 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  30.47 
 
 		 634 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  30.47 
 
 		 634 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  30.82 
 
 		 631 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  31.01 
 
 		 631 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1293  hypothetical protein  52.15 
 
 		 183 aa  169  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.833643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  26.1 
 
 		 585 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  30.3 
 
 		 624 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  28.81 
 
 		 605 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  27.71 
 
 		 935 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  30.28 
 
 		 624 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  29.89 
 
 		 624 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  27.25 
 
 		 715 aa  107  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  23.26 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  24.95 
 
 		 515 aa  94  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  30.91 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  46.08 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  28.68 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  44.12 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  46.08 
 
 		 503 aa  79.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  45.1 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  45.1 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  43.69 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  45.63 
 
 		 622 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  39.42 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  30 
 
 		 386 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  26.24 
 
 		 678 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1647  hypothetical protein  29.63 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>