More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3112 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  100 
 
 		 184 aa  356  9e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  75.82 
 
 		 183 aa  264  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  76.92 
 
 		 183 aa  262  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  69.19 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  68.65 
 
 		 185 aa  248  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  68.16 
 
 		 186 aa  244  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  69.23 
 
 		 185 aa  244  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  68.65 
 
 		 185 aa  241  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  65.36 
 
 		 186 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  65.36 
 
 		 186 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  65.36 
 
 		 186 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  53.04 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  51.14 
 
 		 180 aa  160  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  48.3 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  47.83 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  46.93 
 
 		 313 aa  151  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  47.25 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  46.37 
 
 		 290 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  48.11 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  45.9 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  44.69 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  47.54 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  47.78 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  47.43 
 
 		 189 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  47.78 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  46.93 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  49.72 
 
 		 203 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  45.79 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  45.79 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  41.53 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  46.11 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 206 aa  131  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 206 aa  131  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4606  resolvase domain-containing protein  48.57 
 
 		 140 aa  130  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  40.78 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  43.17 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  41.71 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  44.94 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  41.9 
 
 		 181 aa  121  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  41.14 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  40.57 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  41.99 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  42.22 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  39.89 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  41.08 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  37.99 
 
 		 196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.3 
 
 		 188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.3 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  42.62 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.5 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 199 aa  117  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.33 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  38.46 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.11 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  40.54 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  39.66 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  44.76 
 
 		 190 aa  114  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  45.22 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.33 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  35.91 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  35.91 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  45.22 
 
 		 294 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  45.33 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  40.54 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  40.54 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  40.54 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  38.89 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  34.81 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  36.11 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  44.59 
 
 		 294 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.43 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.76 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  43.95 
 
 		 293 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  36.46 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  45.26 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  43.95 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  40.22 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>