185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2947 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2947  Na+/Picotransporter  100 
 
 
548 aa  1055    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2510  Na+/H+ antiporter  69.6 
 
 
572 aa  652    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.437646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.03 
 
 
576 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0444  hypothetical protein  34.29 
 
 
559 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3663  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.75 
 
 
535 aa  193  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.27 
 
 
556 aa  188  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000135688  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1695  Na+/Picotransporter  38.9 
 
 
571 aa  189  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.483825  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1891  Na+/Pi-cotransporter  38.9 
 
 
571 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.764459  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  29.37 
 
 
551 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  29.37 
 
 
551 aa  186  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  29.37 
 
 
551 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1907  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.06 
 
 
556 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  29.37 
 
 
551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  28.63 
 
 
551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  28.98 
 
 
551 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  28.21 
 
 
544 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  28.98 
 
 
551 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  28.98 
 
 
551 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.91 
 
 
586 aa  183  6e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2859  Na+/H+ antiporter  35.49 
 
 
554 aa  183  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.239008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.78 
 
 
551 aa  181  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.91 
 
 
555 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.91 
 
 
555 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.04 
 
 
551 aa  178  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000310197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.8 
 
 
548 aa  177  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.29 
 
 
590 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.14 
 
 
541 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0543  Na+/Pi-cotransporter  35.35 
 
 
616 aa  173  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.9 
 
 
539 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.08 
 
 
541 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.53 
 
 
541 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  28.01 
 
 
537 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1050  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.84 
 
 
594 aa  170  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.44 
 
 
541 aa  170  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2701  Na+/Pi-cotransporter  30.15 
 
 
611 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.73 
 
 
559 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0226  Na+/Pi-cotransporter  27.88 
 
 
608 aa  168  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654471  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.66 
 
 
556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2560  Na+/phosphate symporter  28.96 
 
 
557 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.46827e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  29.63 
 
 
537 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0962  Na+/Pi-cotransporter  26.59 
 
 
578 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.126514  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.27 
 
 
538 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1964  Na/Pi cotransporter family protein  29.17 
 
 
549 aa  162  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4194  Na+/Pi-cotransporter  33.73 
 
 
613 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32 
 
 
643 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  30.6 
 
 
559 aa  160  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.5 
 
 
536 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2810  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.73 
 
 
584 aa  158  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  29.74 
 
 
562 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9722500000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0549  Na/Pi-cotransporter, putative  28.75 
 
 
589 aa  155  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.04 
 
 
567 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0949  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.42 
 
 
587 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506684 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.77 
 
 
549 aa  153  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0461  Na+/Pi-cotransporter  32.32 
 
 
554 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.790471  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.03 
 
 
564 aa  152  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1943  Na+/Pi-cotransporter  27.29 
 
 
584 aa  151  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1191  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.22 
 
 
570 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.35 
 
 
556 aa  151  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0628  Na/Pi-cotransporter, putative  28.91 
 
 
550 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.99 
 
 
636 aa  147  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1274  Na+/Pi-cotransporter  29.43 
 
 
588 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1721  Na+/Pi-cotransporter  31.97 
 
 
539 aa  144  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24313  hitchhiker  0.00000570659 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1891  Na+/Picotransporter  30.16 
 
 
607 aa  144  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1146  Na/Pi cotransporter II-related  32.4 
 
 
555 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.81 
 
 
565 aa  140  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.89 
 
 
564 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  28.9 
 
 
535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1106  Na+/Pi-cotransporter  24.92 
 
 
593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.174638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2138  Na+/Pi-cotransporter  27.62 
 
 
561 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0273638  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0079  Na+/Pi-cotransporter  30.22 
 
 
592 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0064  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.62 
 
 
318 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.34 
 
 
563 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2431  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.7 
 
 
310 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816248  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1044  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.22 
 
 
574 aa  128  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.16 
 
 
566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.04 
 
 
554 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2287  Na+/Pi-cotransporter  30.34 
 
 
620 aa  124  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.206901  normal  0.033829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1742  Na/Pi-cotransporter family protein  27.88 
 
 
543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.160539  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1777  Na/Pi cotransporter II-related  31.4 
 
 
600 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790059  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1114  Na+/Pi-cotransporter  30.31 
 
 
566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.29 
 
 
311 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.138748  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0064  Na+/Pi-cotransporter  27.42 
 
 
586 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1829  Na+/Pi-cotransporter  27.8 
 
 
543 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4094  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.8 
 
 
304 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.890798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.05 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2155  Na+/Picotransporter  28.65 
 
 
557 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1019  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.69 
 
 
311 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2061  Na+/Picotransporter  29.53 
 
 
557 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.803525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  29.23 
 
 
543 aa  106  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1876  Na+/Pi-cotransporter  32.58 
 
 
289 aa  106  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00688097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  28.6 
 
 
546 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  26.95 
 
 
582 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  27.66 
 
 
582 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  29.97 
 
 
552 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  29.61 
 
 
543 aa  97.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.08 
 
 
548 aa  97.4  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  26.15 
 
 
563 aa  97.1  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  29 
 
 
543 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  29.61 
 
 
543 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  29.61 
 
 
543 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>