More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2896 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  100 
 
 		 355 aa  719    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  79.34 
 
 		 341 aa  540  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  73.77 
 
 		 365 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  71.17 
 
 		 368 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  72.29 
 
 		 369 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  70.87 
 
 		 368 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  70.87 
 
 		 368 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  71.47 
 
 		 338 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  64.53 
 
 		 379 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  61.29 
 
 		 349 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  64.33 
 
 		 344 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  62.97 
 
 		 351 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  60.47 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  60.12 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  60.23 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  59.13 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  60.06 
 
 		 327 aa  381  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  56.12 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  59.43 
 
 		 327 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  57.73 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  57.06 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  57.54 
 
 		 350 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  56.92 
 
 		 349 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  54.98 
 
 		 348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  52.7 
 
 		 370 aa  344  2e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  53.23 
 
 		 333 aa  326  5e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  52.06 
 
 		 342 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  52.82 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  53.24 
 
 		 346 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  53.24 
 
 		 346 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  52.83 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  51.23 
 
 		 348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  50.15 
 
 		 373 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  51.57 
 
 		 375 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  47.9 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  50.16 
 
 		 337 aa  300  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  50.16 
 
 		 322 aa  299  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  52.88 
 
 		 335 aa  293  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  47.3 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  48.78 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  47.48 
 
 		 319 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  47.48 
 
 		 319 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  47.48 
 
 		 319 aa  286  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  47.48 
 
 		 319 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  47.48 
 
 		 319 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  46.86 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  47.8 
 
 		 319 aa  285  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  47.68 
 
 		 320 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  47.17 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  47.17 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  46.54 
 
 		 319 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  47.9 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  46.54 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  47.65 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  46.96 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  46.98 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  46.98 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  45.9 
 
 		 329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  44.25 
 
 		 340 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  47.18 
 
 		 323 aa  272  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  46.3 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  44.58 
 
 		 327 aa  272  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0255  PhoH family protein  45.08 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  47.01 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  42.28 
 
 		 328 aa  269  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  47.55 
 
 		 359 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  47.55 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  43.51 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  48.23 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  47.4 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  45.4 
 
 		 359 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  48.11 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  48.54 
 
 		 348 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  47.84 
 
 		 355 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  46.26 
 
 		 374 aa  265  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  48.54 
 
 		 348 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  48.54 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  47.44 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  47.66 
 
 		 349 aa  264  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  48.54 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  47.53 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  47.53 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  47.81 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  47.53 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  44.85 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2696  PhoH-like protein  46.91 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  47.28 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2038  PhoH family protein  47.04 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1145  PhoH family protein  48.53 
 
 		 317 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2064  PhoH family protein  47.04 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2232  PhoH family protein  43.77 
 
 		 356 aa  263  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211713  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  47.96 
 
 		 328 aa  262  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  46.73 
 
 		 341 aa  262  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0134  PhoH family protein  43.43 
 
 		 319 aa  262  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  44.28 
 
 		 345 aa  262  6.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  47.39 
 
 		 365 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  43.48 
 
 		 333 aa  262  8e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  42.19 
 
 		 322 aa  262  8e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  46.13 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2048  PhoH family protein  45.87 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>