More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2894 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  100 
 
 		 357 aa  702    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  60.45 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  57.88 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  56.79 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  56.79 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  54.68 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  51.9 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  56.59 
 
 		 377 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  50.78 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  48.94 
 
 		 375 aa  276  5e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  51.41 
 
 		 374 aa  276  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  50.48 
 
 		 381 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  50.47 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  49.53 
 
 		 375 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  46.82 
 
 		 420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  47.83 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  44.54 
 
 		 345 aa  252  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  44.41 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  48.1 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  47.76 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  48.73 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  47.68 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  47.78 
 
 		 374 aa  236  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  47.78 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.84 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  42.09 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  39.88 
 
 		 324 aa  206  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  38.39 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  39.68 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  38.25 
 
 		 318 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  38.62 
 
 		 312 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  36.23 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  43.87 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  39.42 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 		 315 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  36.09 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  40.2 
 
 		 296 aa  179  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  36.78 
 
 		 304 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  33.94 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  33.44 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  32.34 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  32.42 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  32.74 
 
 		 291 aa  169  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  33.95 
 
 		 291 aa  169  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 		 291 aa  169  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  34.25 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.12 
 
 		 292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  32.21 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  33.56 
 
 		 273 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  33.02 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.54 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  40.68 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  33.74 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  32.93 
 
 		 371 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  33.21 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  32.86 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  34.87 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  32.2 
 
 		 298 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  30.62 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  31.61 
 
 		 273 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  30.62 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  33.81 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  36.09 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  32.39 
 
 		 275 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  31.46 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  31.23 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  31.46 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.25 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  33 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  30.37 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 279 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  35.71 
 
 		 490 aa  150  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  34.07 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  34.07 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  31.38 
 
 		 284 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  32 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  33.94 
 
 		 250 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  37.1 
 
 		 442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  33.11 
 
 		 285 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  32.61 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  32.44 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  30.98 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3980  CBS domain containing protein  34.12 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  30.22 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3902  CBS domain containing protein  34.12 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  30.43 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 		 296 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  30.22 
 
 		 279 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  36.65 
 
 		 464 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  27.71 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  31.27 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.32 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  30.22 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>