More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2893 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 576 aa  1118    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  53.55 
 
 		 550 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  55.31 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  54.5 
 
 		 567 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  54.27 
 
 		 567 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  52.88 
 
 		 553 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  50.83 
 
 		 543 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  55.51 
 
 		 566 aa  458  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  49.16 
 
 		 536 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  48.58 
 
 		 541 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  48.77 
 
 		 536 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  45.82 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  47.34 
 
 		 536 aa  425  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  48.95 
 
 		 540 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  46.35 
 
 		 536 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  46.75 
 
 		 534 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  43.26 
 
 		 532 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  43.34 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  42.93 
 
 		 532 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  43.12 
 
 		 532 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  41.3 
 
 		 528 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  41.13 
 
 		 534 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  41.17 
 
 		 534 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  39.78 
 
 		 543 aa  336  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  37.13 
 
 		 541 aa  318  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  37.5 
 
 		 531 aa  258  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  37.07 
 
 		 523 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  37.07 
 
 		 523 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  36.31 
 
 		 537 aa  248  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  31.43 
 
 		 501 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  36.48 
 
 		 502 aa  243  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  36.49 
 
 		 525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  35.75 
 
 		 528 aa  241  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  38.31 
 
 		 495 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  38 
 
 		 495 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  37.26 
 
 		 495 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  29.18 
 
 		 488 aa  219  8.999999999999998e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  35.47 
 
 		 487 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  37.95 
 
 		 497 aa  210  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  28.46 
 
 		 472 aa  209  9e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  33.41 
 
 		 508 aa  209  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  32.23 
 
 		 573 aa  194  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  33.53 
 
 		 542 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  31.98 
 
 		 522 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  36.96 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  31.13 
 
 		 521 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  32.04 
 
 		 521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  32.91 
 
 		 528 aa  176  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.38 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  34.57 
 
 		 525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  31.1 
 
 		 514 aa  174  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  29.18 
 
 		 507 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  29.63 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  35.42 
 
 		 588 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  30.57 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  36.07 
 
 		 524 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  33.2 
 
 		 522 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  32.81 
 
 		 503 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  28.41 
 
 		 524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  28.22 
 
 		 524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  32.51 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  32.59 
 
 		 503 aa  165  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  33.26 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  31.15 
 
 		 477 aa  163  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  30.52 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  29.27 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  32.58 
 
 		 523 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  31.97 
 
 		 505 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 		 523 aa  160  7e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  34.35 
 
 		 479 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  32.62 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  29.67 
 
 		 509 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  28.12 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  28.05 
 
 		 513 aa  157  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  32.53 
 
 		 505 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  30.33 
 
 		 532 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  30.18 
 
 		 537 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  30.61 
 
 		 520 aa  154  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  31.53 
 
 		 505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  29.59 
 
 		 504 aa  153  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  28.95 
 
 		 506 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  31.68 
 
 		 505 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  30.8 
 
 		 521 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  29.24 
 
 		 509 aa  151  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  28.99 
 
 		 529 aa  150  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  32.12 
 
 		 507 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  29.58 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  30.87 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  30 
 
 		 509 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  28.27 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  30.9 
 
 		 567 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  28.87 
 
 		 511 aa  147  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 		 553 aa  147  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  33.05 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  29.69 
 
 		 554 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 		 524 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  27.87 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  26.13 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  31.13 
 
 		 505 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>