79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2883 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  100 
 
 
541 aa  1082    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  56.76 
 
 
453 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  52.13 
 
 
433 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
645 aa  98.6  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  34.45 
 
 
409 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  33.13 
 
 
554 aa  93.2  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  34.95 
 
 
409 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  36.25 
 
 
411 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  31.48 
 
 
565 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  31.1 
 
 
580 aa  83.6  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  36.13 
 
 
180 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  21.28 
 
 
497 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  39.82 
 
 
480 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  27.84 
 
 
458 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  41.51 
 
 
463 aa  80.1  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  32.92 
 
 
777 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  38.68 
 
 
508 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  26.99 
 
 
604 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  38.68 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  30.05 
 
 
485 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  29.38 
 
 
681 aa  76.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  30.58 
 
 
460 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  30.4 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  30.4 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  30.4 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  30.4 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  29.52 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  29.52 
 
 
477 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  30.4 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  27.55 
 
 
572 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  32.31 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  40.48 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
398 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  35.04 
 
 
495 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05854  hypothetical protein  35.23 
 
 
504 aa  65.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  31.87 
 
 
470 aa  63.9  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  32.91 
 
 
397 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  25.41 
 
 
453 aa  60.5  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  40.24 
 
 
108 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2619  FHA domain-containing protein  34.58 
 
 
189 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2122  FHA domain-containing protein  34.58 
 
 
189 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.47433  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3229  FHA domain-containing protein  35.51 
 
 
189 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  31.37 
 
 
398 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  30 
 
 
503 aa  55.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 
436 aa  53.9  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  33.73 
 
 
400 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
409 aa  53.5  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  32 
 
 
397 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  35.05 
 
 
252 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  44.93 
 
 
238 aa  50.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  38.67 
 
 
245 aa  50.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  36.36 
 
 
694 aa  50.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6044  forkhead-type phosphopeptide-binding protein  34.88 
 
 
419 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0050  FHA domain-containing protein  30.63 
 
 
236 aa  49.3  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.824119  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  34.02 
 
 
162 aa  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3859  FHA domain-containing protein  34.95 
 
 
195 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  53.06 
 
 
1065 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0031  Forkhead-associated protein  37.23 
 
 
433 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  36.54 
 
 
428 aa  47.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4616  FHA domain containing protein  40 
 
 
328 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  34.07 
 
 
310 aa  47  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  34.78 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0091  FHA domain containing protein  41.79 
 
 
170 aa  47  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0330  FHA domain-containing protein  34.67 
 
 
144 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0338  FHA domain-containing protein  34.67 
 
 
144 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  31.91 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0013  FHA domain containing protein  37.63 
 
 
170 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.943282  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  31.73 
 
 
406 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4593  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.47 
 
 
665 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273908  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.38 
 
 
851 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1179  putative type VI secretion protein VasC-1  34.38 
 
 
314 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  38.36 
 
 
241 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  34.18 
 
 
770 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  44.26 
 
 
475 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41175  predicted protein  34.33 
 
 
720 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
236 aa  44.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  30.36 
 
 
894 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3386  FHA domain-containing protein  48.89 
 
 
230 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0029589  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0534  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
272 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.895952  normal  0.110331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>