More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2846 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  100 
 
 
604 aa  1184  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  75.08 
 
 
605 aa  901  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  33.63 
 
 
573 aa  297  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  33.51 
 
 
580 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.9535e-08  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  35.58 
 
 
730 aa  276  6e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  32.06 
 
 
626 aa  255  2e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  31.79 
 
 
608 aa  251  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  36.98 
 
 
577 aa  247  5e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  31.19 
 
 
584 aa  245  2e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  32.26 
 
 
603 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  33.27 
 
 
729 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  31.45 
 
 
703 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  33.01 
 
 
517 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  30.8 
 
 
711 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  1.3918e-05 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  31.73 
 
 
599 aa  227  5e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  31.12 
 
 
603 aa  226  9e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  32.58 
 
 
517 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  32.18 
 
 
620 aa  221  2e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  29.58 
 
 
703 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  32.86 
 
 
620 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  27.65 
 
 
550 aa  217  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  27.68 
 
 
570 aa  213  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  30.62 
 
 
711 aa  213  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  28.33 
 
 
583 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  33.87 
 
 
522 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  30.58 
 
 
522 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2436  sulphate transporter  31.42 
 
 
549 aa  205  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.59657  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  27.93 
 
 
567 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  27.95 
 
 
567 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  26.7 
 
 
587 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  36.26 
 
 
698 aa  203  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  31.03 
 
 
558 aa  202  1e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  30 
 
 
522 aa  202  2e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  27.57 
 
 
587 aa  200  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  29.94 
 
 
551 aa  200  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  30.04 
 
 
521 aa  199  1e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  1.10429e-09 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  27.53 
 
 
568 aa  199  1e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  29.96 
 
 
572 aa  197  5e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  28.92 
 
 
586 aa  197  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  31.39 
 
 
546 aa  197  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  26.99 
 
 
552 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1686  sulfate transporter  27.85 
 
 
552 aa  194  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  31.1 
 
 
584 aa  193  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  32.59 
 
 
574 aa  193  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  27.73 
 
 
588 aa  193  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  29.98 
 
 
559 aa  192  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  27.86 
 
 
571 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  26.94 
 
 
552 aa  191  3e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  29.98 
 
 
578 aa  190  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  29.17 
 
 
521 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  9.1476e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  29.53 
 
 
521 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  28.25 
 
 
585 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  27.12 
 
 
552 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  30.75 
 
 
559 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  28.95 
 
 
581 aa  186  1e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  29.33 
 
 
590 aa  186  1e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  30.62 
 
 
591 aa  186  1e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2371  sulphate transporter  28.8 
 
 
604 aa  185  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  29.44 
 
 
552 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  31.4 
 
 
584 aa  182  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  26.4 
 
 
563 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  30.85 
 
 
601 aa  182  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  31.11 
 
 
571 aa  181  3e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  30.92 
 
 
588 aa  181  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3236  sulphate transporter  29.92 
 
 
562 aa  180  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  29.17 
 
 
592 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  28.57 
 
 
560 aa  177  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  27.83 
 
 
588 aa  176  1e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  30.14 
 
 
581 aa  175  2e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0743  sulphate transporter  27.99 
 
 
594 aa  175  2e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  32.66 
 
 
572 aa  175  2e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  27.73 
 
 
563 aa  174  3e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  30.18 
 
 
571 aa  174  4e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  28.42 
 
 
585 aa  174  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  30.39 
 
 
581 aa  174  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  28.16 
 
 
558 aa  173  8e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  26.4 
 
 
570 aa  172  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4228  sulphate transporter  32.02 
 
 
536 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  30.49 
 
 
605 aa  171  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  26.36 
 
 
556 aa  171  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  27.4 
 
 
553 aa  170  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.18031e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  33.41 
 
 
573 aa  170  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  32.48 
 
 
590 aa  170  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  29.71 
 
 
521 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  27.08 
 
 
574 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  25.72 
 
 
551 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0891  putative sulfate transporter  29.22 
 
 
565 aa  166  9e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  26.7 
 
 
553 aa  166  1e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  25.8 
 
 
545 aa  166  1e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  25.53 
 
 
551 aa  165  2e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  32.75 
 
 
426 aa  165  2e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  29.39 
 
 
588 aa  165  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  25.22 
 
 
568 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  25.54 
 
 
568 aa  164  4e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  27.98 
 
 
579 aa  164  5e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  29.83 
 
 
584 aa  164  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  26.04 
 
 
606 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3029  sulphate transporter  28.57 
 
 
549 aa  162  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  26.19 
 
 
572 aa  162  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  27.64 
 
 
558 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>