172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2805 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 357 aa  712    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  58.52 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  41.18 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  39.51 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  39.24 
 
 		 360 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  38.65 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  41.69 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  41.3 
 
 		 359 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  39.38 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  33.61 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.05 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  33.05 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  31.94 
 
 		 456 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 297 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  28.51 
 
 		 455 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  31.64 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  31.5 
 
 		 302 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  31.7 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  33.62 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  40 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  32.75 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  44.85 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  31.96 
 
 		 458 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  43.28 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  30.72 
 
 		 289 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  32.47 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  28.75 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  29.43 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  27.75 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  28.45 
 
 		 307 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  38.89 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  37.67 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  26.93 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  27.46 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  27.95 
 
 		 312 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  31.3 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.3 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  26.93 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  30.21 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  29.51 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  30.4 
 
 		 312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  29.51 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  26.35 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  30.47 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  35.81 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  29.48 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  35.35 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  26.38 
 
 		 312 aa  123  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  38.74 
 
 		 378 aa  122  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  33.17 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  31.25 
 
 		 579 aa  115  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  29.51 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.72 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  31.72 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  31.17 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  31.62 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  28.08 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  32.33 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  33.47 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  29.66 
 
 		 307 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  29.66 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  25.84 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  23.36 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  29.73 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.21 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  27.8 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.21 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  25.29 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  29.59 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  24.57 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  24.32 
 
 		 316 aa  87.8  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.89 
 
 		 296 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  29.6 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  25.8 
 
 		 310 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  29.32 
 
 		 325 aa  87  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  24.74 
 
 		 310 aa  86.7  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  25.26 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.15 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0661  hypothetical protein  36.24 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  28.21 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  30.65 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  26.83 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  30.6 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  26.86 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  41.13 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  24.16 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  28.52 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  24.57 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  27.81 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  24.04 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  25.16 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  26.32 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  26.7 
 
 		 288 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  24.44 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  25.13 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.5 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  28.57 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  28.57 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>