More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2735 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  45.78 
 
 
1239 aa  1007    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  44.02 
 
 
1301 aa  962    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  46.03 
 
 
1265 aa  977    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
1220 aa  2503    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  45.64 
 
 
1271 aa  958    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  43.38 
 
 
1292 aa  936    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  44.21 
 
 
1303 aa  976    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  35.36 
 
 
1147 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.2 
 
 
1867 aa  506  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  31.7 
 
 
1608 aa  326  1e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
924 aa  290  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  38.99 
 
 
404 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  38.99 
 
 
404 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
740 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
740 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7833  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
732 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
828 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
441 aa  102  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.38 
 
 
778 aa  90.9  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
539 aa  89  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
673 aa  88.6  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
1476 aa  85.9  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
418 aa  86.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
447 aa  84  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
419 aa  80.9  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
953 aa  79.7  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
397 aa  79.7  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
1067 aa  75.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  23.96 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
440 aa  72  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  22.25 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 
445 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0239  glycosyl transferase group 1  60 
 
 
595 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  23.25 
 
 
372 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
819 aa  64.3  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  45.78 
 
 
384 aa  64.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
1317 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
354 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
354 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1388  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
354 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
354 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
354 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
354 aa  62  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.89 
 
 
2401 aa  62  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.41 
 
 
354 aa  61.6  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 
436 aa  61.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  25.17 
 
 
413 aa  60.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
417 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3945  hypothetical protein  31.34 
 
 
547 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.93 
 
 
354 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.93 
 
 
354 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
782 aa  60.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.93 
 
 
354 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
413 aa  60.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  24.93 
 
 
354 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.93 
 
 
354 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  28.11 
 
 
1444 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.93 
 
 
354 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.93 
 
 
354 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
871 aa  59.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
411 aa  58.9  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  22.13 
 
 
401 aa  58.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
816 aa  58.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
430 aa  58.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
437 aa  58.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
437 aa  58.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.99 
 
 
412 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
384 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
394 aa  58.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2374  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
373 aa  57  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.47 
 
 
400 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
400 aa  56.2  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
356 aa  56.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
364 aa  56.2  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  22.16 
 
 
413 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.47 
 
 
354 aa  55.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1737  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
395 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  44.62 
 
 
377 aa  56.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 
369 aa  55.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
355 aa  55.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
386 aa  55.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.16 
 
 
388 aa  55.5  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0478  glycosyl transferase, group 1  19.55 
 
 
442 aa  55.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.038549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 
452 aa  55.1  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
381 aa  55.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
367 aa  54.7  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
372 aa  54.3  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
404 aa  54.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
733 aa  54.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  25.21 
 
 
355 aa  54.3  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
375 aa  54.3  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  37.36 
 
 
355 aa  54.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 
414 aa  54.3  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.47 
 
 
354 aa  53.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
772 aa  53.5  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  27.07 
 
 
360 aa  53.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
354 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.2 
 
 
354 aa  53.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>