More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2606 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  38.55 
 
 		 1241 aa  820    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  53.53 
 
 		 1207 aa  1231    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  100 
 
 		 1172 aa  2377    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  58.21 
 
 		 1205 aa  1345    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  59.52 
 
 		 1204 aa  1412    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  53.97 
 
 		 1205 aa  1189    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  54.06 
 
 		 1226 aa  1290    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  60.85 
 
 		 1205 aa  1465    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  54.56 
 
 		 677 aa  698    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  63.86 
 
 		 1179 aa  1527    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  55.51 
 
 		 1488 aa  848    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  58.21 
 
 		 1201 aa  1343    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  64.49 
 
 		 1176 aa  1499    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  59.72 
 
 		 1208 aa  1423    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  57.86 
 
 		 1233 aa  1359    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  53.28 
 
 		 1204 aa  1204    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  54.15 
 
 		 1204 aa  1265    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  54.93 
 
 		 1210 aa  1311    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  55.59 
 
 		 1203 aa  1293    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  54.05 
 
 		 663 aa  688    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  58.84 
 
 		 1203 aa  1375    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  55.17 
 
 		 1200 aa  1291    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  55.54 
 
 		 1206 aa  1332    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  56.02 
 
 		 1212 aa  1377    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  50.54 
 
 		 1212 aa  1073    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  53.37 
 
 		 1231 aa  1247    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  55.93 
 
 		 1228 aa  1311    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  63.45 
 
 		 1179 aa  1468    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  53.89 
 
 		 1197 aa  1248    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  56.71 
 
 		 1200 aa  1332    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  55.36 
 
 		 1243 aa  1290    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  54.04 
 
 		 1209 aa  1284    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  54.84 
 
 		 1201 aa  1280    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  64.02 
 
 		 1183 aa  1523    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  51.62 
 
 		 1201 aa  1172    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  57.11 
 
 		 1203 aa  1343    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  58.37 
 
 		 1205 aa  1342    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  62.63 
 
 		 1183 aa  1504    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  51.07 
 
 		 1220 aa  1133    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  53.86 
 
 		 1204 aa  1258    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  53.8 
 
 		 1209 aa  1231    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  44.85 
 
 		 1822 aa  1041    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  58.63 
 
 		 1205 aa  1349    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  53.97 
 
 		 1205 aa  1189    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  63.69 
 
 		 1179 aa  1520    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  64.6 
 
 		 1180 aa  1496    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  51.79 
 
 		 1208 aa  1208    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  53.97 
 
 		 1205 aa  1191    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  64.49 
 
 		 1176 aa  1506    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  60.26 
 
 		 1162 aa  1312    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  55.79 
 
 		 1238 aa  1278    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  52.73 
 
 		 1204 aa  1119    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  63.4 
 
 		 1182 aa  1520    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  52.13 
 
 		 1234 aa  1163    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  55.16 
 
 		 1197 aa  1274    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  58.63 
 
 		 1205 aa  1349    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  57.52 
 
 		 1209 aa  1375    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0815  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.54 
 
 		 673 aa  426  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.450975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  51.36 
 
 		 673 aa  423  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0018  biotin carboxylase  51.36 
 
 		 673 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  49.19 
 
 		 445 aa  422  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3181  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.33 
 
 		 667 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1869  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.8 
 
 		 676 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2002  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.06 
 
 		 667 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0385  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.44 
 
 		 671 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  47.77 
 
 		 655 aa  419  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1878  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.89 
 
 		 673 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1223  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.56 
 
 		 668 aa  420  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.67 
 
 		 670 aa  418  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.67 
 
 		 666 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.44 
 
 		 671 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0039  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.57 
 
 		 655 aa  418  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2604  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.73 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.189257  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3684  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.19 
 
 		 685 aa  416  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.82326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2191  propionyl-CoA carboxylase alpha subunit  49.67 
 
 		 695 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2379  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.25 
 
 		 682 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4726  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.22 
 
 		 675 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248111  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  47.95 
 
 		 686 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0723  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.49 
 
 		 681 aa  416  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1874  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.04 
 
 		 669 aa  416  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  47.75 
 
 		 447 aa  416  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3221  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  45.37 
 
 		 667 aa  416  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.390977 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2302  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.44 
 
 		 666 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.73 
 
 		 445 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.97 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.569347  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1189  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.44 
 
 		 667 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2370  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.5 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.17472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2328  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.73 
 
 		 445 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.611182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2286  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.73 
 
 		 445 aa  413  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2996  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  45.19 
 
 		 684 aa  412  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2548  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.5 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3370  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.63 
 
 		 680 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0913  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.79 
 
 		 678 aa  412  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3585  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.02 
 
 		 671 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.930093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.5 
 
 		 445 aa  412  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1149  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.44 
 
 		 667 aa  411  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.5 
 
 		 445 aa  413  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3000  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.72 
 
 		 669 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2693  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.6 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.25688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3756  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.12 
 
 		 682 aa  409  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0388867  normal  0.0417354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>