More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2589 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  100 
 
 
219 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  62.16 
 
 
221 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  54.66 
 
 
226 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  52.5 
 
 
222 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  49.47 
 
 
245 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  40.96 
 
 
205 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  45.3 
 
 
212 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  44.62 
 
 
211 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  44.44 
 
 
211 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  49.68 
 
 
260 aa  148  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  43.92 
 
 
211 aa  147  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  45.66 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  44.2 
 
 
212 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  45.16 
 
 
211 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  45.24 
 
 
233 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  49.09 
 
 
277 aa  141  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  50 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  45.24 
 
 
237 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  50 
 
 
205 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  43.24 
 
 
201 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  39.9 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  44.03 
 
 
213 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  45.41 
 
 
193 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  39.77 
 
 
234 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  40.31 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  44.65 
 
 
213 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  44.65 
 
 
213 aa  128  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  41.92 
 
 
221 aa  127  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  42.77 
 
 
210 aa  127  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  42.94 
 
 
211 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  40.66 
 
 
209 aa  124  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  34.54 
 
 
215 aa  124  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  38.1 
 
 
206 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  38.1 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  40.44 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  42.94 
 
 
208 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  36.05 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  35.29 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  31.28 
 
 
201 aa  95.5  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  33.93 
 
 
239 aa  89  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  33.68 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  31.37 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  30.05 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  42.25 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  36.26 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  32.73 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  30 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  29.79 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  39.16 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  31.58 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  30.12 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  32.2 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 
236 aa  78.2  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.11 
 
 
218 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  31.55 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  32.57 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  29.32 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  29.32 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  29.32 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  29.32 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  30.22 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  30.22 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  30.22 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  30.22 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  30.22 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  30.22 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  29.63 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  30.22 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  30.22 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  31.82 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  28.75 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  32.99 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  33.54 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  35.46 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  32.14 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  31.25 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  27.98 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  32.14 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  31.82 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  34.94 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  30.65 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  32.14 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  30.16 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  28.16 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  30.41 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  28.16 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  30.41 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  33.57 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  31.31 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  31.07 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  35.42 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0895  methyltransferase GidB  27.13 
 
 
202 aa  72  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  34.25 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  31.03 
 
 
252 aa  71.6  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1568  methyltransferase GidB  30.14 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.975144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>