71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2517 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 349 aa  682    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  59.54 
 
 		 343 aa  335  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  58.78 
 
 		 317 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  54.58 
 
 		 322 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  57.97 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  55.74 
 
 		 326 aa  288  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  55.74 
 
 		 326 aa  288  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  55.41 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  50.52 
 
 		 314 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  47.65 
 
 		 323 aa  278  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  45.36 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  45.36 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  45.57 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  50.71 
 
 		 319 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  47.06 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  50.69 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  49.63 
 
 		 327 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  46.13 
 
 		 328 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  49.63 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  39.44 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  42.09 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  40.73 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  43.46 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  37.38 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  43.71 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  36.39 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  39.81 
 
 		 298 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  34.6 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  31.16 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  32 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  35.12 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  29.8 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  29.8 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  37.26 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  32.26 
 
 		 311 aa  97.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  33.91 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  33.88 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  28.85 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  34.68 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  33.97 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  25.23 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  25.23 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  25.23 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  28.78 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  25.47 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  27.09 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  23.99 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1883  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  27.73 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2303  hypothetical protein  30.07 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.826332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  26.56 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  27.41 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  27.08 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  25.21 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  27.18 
 
 		 317 aa  49.7  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  27.33 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1760  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  27.7 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  26.96 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  25.57 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03535  cell division protein  25.63 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0178612  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0427  cell division protein, putative  27.17 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  25.14 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2372  cell division protein FtsX  26.52 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000210413  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4326  hypothetical protein  26.44 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0527  cell division protein, putative  25.98 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000882994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  26.85 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00278  cell division protein  21.83 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2182  cell division protein FtsX  25.77 
 
 		 292 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>