More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2512 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 453 aa  912    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.97 
 
 		 456 aa  667    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.78 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.97 
 
 		 462 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  61.73 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.06 
 
 		 462 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  61.73 
 
 		 468 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.02 
 
 		 472 aa  561  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  63.95 
 
 		 462 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.45 
 
 		 464 aa  559  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  62.61 
 
 		 472 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.71 
 
 		 474 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.39 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  64.43 
 
 		 466 aa  542  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.16 
 
 		 477 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.18 
 
 		 472 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.28 
 
 		 460 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.45 
 
 		 469 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  56.82 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.59 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3166  two component sensor kinase  57.4 
 
 		 440 aa  480  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.28 
 
 		 447 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  59.63 
 
 		 432 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  55.33 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  59.76 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.14 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 450 aa  347  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 439 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  41.03 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 439 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  40.63 
 
 		 439 aa  282  9e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 467 aa  279  6e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 442 aa  262  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 435 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 717 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 488 aa  182  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 488 aa  182  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  38.08 
 
 		 435 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 494 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.11 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  31.09 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  31.32 
 
 		 458 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  39.42 
 
 		 276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  35.93 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 349 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 443 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  31.16 
 
 		 440 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 493 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  38.74 
 
 		 391 aa  160  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  28.41 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  38.17 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  30.24 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  30.24 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  35.59 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 463 aa  154  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  35.71 
 
 		 434 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 428 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  36.93 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 535 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  35.46 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  36.93 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  29.23 
 
 		 440 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  40 
 
 		 270 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  31.61 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  30.11 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  35.07 
 
 		 457 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  35.07 
 
 		 457 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  35.97 
 
 		 442 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  35.07 
 
 		 457 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  35.07 
 
 		 457 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 451 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  34.83 
 
 		 344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>