54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2486 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  100 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  75.32 
 
 		 192 aa  250  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  58.75 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  55.43 
 
 		 174 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  58.82 
 
 		 176 aa  202  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  56.82 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  66.01 
 
 		 194 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  64.05 
 
 		 187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  57.14 
 
 		 174 aa  193  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  57.14 
 
 		 174 aa  190  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  62.94 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  55.19 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  64.23 
 
 		 137 aa  183  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  59.87 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  59.87 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  57.96 
 
 		 197 aa  178  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  47.95 
 
 		 179 aa  164  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  52.41 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  44.57 
 
 		 185 aa  158  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  45.98 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  46.78 
 
 		 245 aa  157  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  44.16 
 
 		 179 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  44.16 
 
 		 179 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  44.76 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  41.38 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  45.52 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  45.24 
 
 		 239 aa  140  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  44.83 
 
 		 203 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  44.83 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  47.52 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  46.1 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  43.14 
 
 		 200 aa  127  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  38.2 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  38.41 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  41.73 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  39.04 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  34.74 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  39.26 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  35.86 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  32.53 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  28.7 
 
 		 367 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  40.52 
 
 		 113 aa  89  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  27.34 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  33.73 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  32.48 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  31.43 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  30.71 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  30.82 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  30.82 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  30.47 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  25.32 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  30.39 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  36.36 
 
 		 539 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>