More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2483 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2483  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 399 aa  817    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0486018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1696  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5853  putative glycosyl transferase  28.7 
 
 		 410 aa  96.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0350572  normal  0.772659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0790  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4435  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.29 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0287  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  27.43 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  25.52 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  23.74 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  22.41 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  26.55 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0110  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.2 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000484936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6087  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0801874  hitchhiker  0.00307291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 		 363 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  25.99 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3441  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 		 894 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.29 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  34.42 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2978  glycosyltransferase-like protein  23.63 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1689  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  27.27 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  28.75 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.44 
 
 		 360 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  25.75 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2475  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.770034  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  27.45 
 
 		 1188 aa  53.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 370 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 378 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 457 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 389 aa  53.1  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2615  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 395 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 418 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 358 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3442  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 337 aa  53.1  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 377 aa  53.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 452 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2891  a-glycosyltransferase  28.17 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000073118  normal  0.0276077 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  30.82 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0506  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.769782  normal  0.0165871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.39 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 468 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.97 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 356 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1672  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 359 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  29.05 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.92 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3821  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00699792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 871 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  28.44 
 
 		 569 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.09 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>