More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2449 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  56.79 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  56.2 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  56.2 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3456  ABC transporter related  56.47 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000578297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  54.03 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  54.55 
 
 		 266 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45.15 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.71 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48.15 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.22 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4894  ABC transporter related  57.59 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  44.4 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.61 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  51.9 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  51.16 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.56 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0181  ABC transporter related  56.99 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.945523  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  47.88 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  43.82 
 
 		 263 aa  198  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1390  NO3-/NO2- ABC transporter  42.69 
 
 		 266 aa  198  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  50.47 
 
 		 288 aa  198  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.96 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  50.47 
 
 		 271 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  49.3 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  50.7 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.05 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.37 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  48.47 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  38.98 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  50.72 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.85 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  47.52 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  45.23 
 
 		 272 aa  195  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  47.03 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  43.86 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  49.52 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 446 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 446 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 446 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 446 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 446 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 446 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 446 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  46.26 
 
 		 445 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  51.49 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  46.26 
 
 		 445 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  49.77 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  46.26 
 
 		 448 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  50.24 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  41.18 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  41.02 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  51.49 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  46.26 
 
 		 445 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  46.26 
 
 		 453 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  46.26 
 
 		 445 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  46.26 
 
 		 445 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.75 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  46.26 
 
 		 448 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  46.26 
 
 		 450 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.86 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.26 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.93 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  46.26 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  48 
 
 		 306 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 284 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.78 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.3 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  46.43 
 
 		 308 aa  192  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  44.9 
 
 		 289 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.51 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  45.45 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  45.81 
 
 		 445 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.19 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  42.74 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  45.87 
 
 		 436 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  43.5 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.08 
 
 		 283 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.26 
 
 		 272 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  43.15 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  48.8 
 
 		 263 aa  191  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.26 
 
 		 448 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  50.76 
 
 		 289 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 290 aa  191  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  43.15 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  43.48 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.29 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  45.81 
 
 		 448 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.16 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  45.81 
 
 		 448 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>