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for query gene Msil_2443 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 237 aa  473  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  33.17 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  29.38 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 		 213 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 207 aa  99.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 212 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 209 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 218 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 203 aa  95.9  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 207 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  30.53 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.43 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 208 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 212 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.57 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 198 aa  90.1  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 218 aa  88.6  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 222 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  31.34 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  29.02 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 210 aa  85.1  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  30.85 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
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NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  33.66 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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