39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2415 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  42.36 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2201  hypothetical protein  36.62 
 
 		 148 aa  84  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  33.1 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  36.88 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  33.11 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  33.11 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  32.84 
 
 		 145 aa  67  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  30.77 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  26.24 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  30.07 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  26.92 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  34.83 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  30.5 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  26.35 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  27.56 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  27.97 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  27.74 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  28.08 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  24.82 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  28.37 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  26.47 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  27.54 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  28.67 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  28.76 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  28.26 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  33.59 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  22.7 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  23.97 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  26 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  26.24 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  31.5 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  33.33 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  28.75 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  33.33 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  31.39 
 
 		 132 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  31.01 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  24.11 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>