175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2364 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  62.63 
 
 		 647 aa  817    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  100 
 
 		 652 aa  1316    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  38.5 
 
 		 619 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  38.5 
 
 		 619 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  38.36 
 
 		 619 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  36.66 
 
 		 625 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.24 
 
 		 630 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  35.47 
 
 		 623 aa  361  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  35.93 
 
 		 623 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  35.68 
 
 		 623 aa  359  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  35.53 
 
 		 623 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  35.53 
 
 		 623 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  35.53 
 
 		 623 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  35.53 
 
 		 623 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  35.53 
 
 		 623 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  35.53 
 
 		 623 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  35 
 
 		 638 aa  354  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  35.18 
 
 		 620 aa  350  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.23 
 
 		 623 aa  348  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  34.09 
 
 		 624 aa  340  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32 
 
 		 624 aa  340  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  32.23 
 
 		 628 aa  336  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  33.49 
 
 		 629 aa  328  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  32.47 
 
 		 629 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  32.01 
 
 		 624 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.62 
 
 		 629 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  32.98 
 
 		 629 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  32.98 
 
 		 629 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  32.98 
 
 		 629 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  32.98 
 
 		 629 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  32.98 
 
 		 629 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  32.98 
 
 		 629 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  32.83 
 
 		 629 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  33.08 
 
 		 626 aa  317  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  32.62 
 
 		 629 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  32.92 
 
 		 626 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  32.92 
 
 		 626 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  32.16 
 
 		 626 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  32.82 
 
 		 626 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  32.01 
 
 		 626 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  31.16 
 
 		 630 aa  300  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.59 
 
 		 626 aa  296  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  31.82 
 
 		 639 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  32.68 
 
 		 654 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  30.09 
 
 		 629 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  29.75 
 
 		 627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  29.16 
 
 		 629 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  29.75 
 
 		 627 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  29.88 
 
 		 626 aa  283  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  29.88 
 
 		 626 aa  283  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  29.88 
 
 		 626 aa  283  8.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  29.6 
 
 		 627 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  30.85 
 
 		 610 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.27 
 
 		 628 aa  263  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  30.7 
 
 		 606 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  30.85 
 
 		 606 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  30.77 
 
 		 606 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  30.38 
 
 		 606 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  29.68 
 
 		 611 aa  239  9e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  27.95 
 
 		 609 aa  233  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  30.02 
 
 		 605 aa  230  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  30.32 
 
 		 597 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  30.84 
 
 		 597 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  28.51 
 
 		 633 aa  229  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  31.51 
 
 		 621 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.45 
 
 		 590 aa  228  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  32.73 
 
 		 620 aa  226  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  29.04 
 
 		 586 aa  224  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  29.13 
 
 		 589 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.85 
 
 		 590 aa  221  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  26.17 
 
 		 607 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  28.79 
 
 		 589 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  27.29 
 
 		 637 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  31.2 
 
 		 621 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.93 
 
 		 642 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  29.46 
 
 		 597 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  29.32 
 
 		 616 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  28.85 
 
 		 612 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  28.85 
 
 		 612 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  28.85 
 
 		 612 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  28.7 
 
 		 612 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  28.7 
 
 		 612 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  26.45 
 
 		 590 aa  197  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  28.79 
 
 		 612 aa  196  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.42 
 
 		 612 aa  190  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  27.91 
 
 		 611 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  27.91 
 
 		 611 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  28.18 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  27.91 
 
 		 611 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  27.18 
 
 		 588 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  27.29 
 
 		 593 aa  186  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  27.61 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  28.13 
 
 		 611 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  27.25 
 
 		 611 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  27.61 
 
 		 611 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  27.61 
 
 		 611 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  27.35 
 
 		 588 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  26.73 
 
 		 592 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  26.32 
 
 		 588 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  26.09 
 
 		 588 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>