47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2358 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2358  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  876    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0645311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3042  hypothetical protein  39.59 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.19 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  28.45 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  28.73 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  29.43 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  29.15 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.01 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  27.32 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  27.33 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.98 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  24.87 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  29.07 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  23.48 
 
 		 366 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  23.39 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  23.96 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  23.69 
 
 		 339 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  24.25 
 
 		 365 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  31.19 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  24.49 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  31.19 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  24.4 
 
 		 363 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  26.35 
 
 		 361 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  40 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  24.59 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  22.7 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  22.47 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  28.77 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  25.85 
 
 		 365 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  30.43 
 
 		 371 aa  47.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.08 
 
 		 369 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  24.02 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  37.5 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  43.14 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  43.14 
 
 		 364 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  37.5 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  43.14 
 
 		 364 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  22.44 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.63 
 
 		 439 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  26.26 
 
 		 371 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  27.59 
 
 		 373 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  27.59 
 
 		 373 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  27.59 
 
 		 373 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  27.59 
 
 		 373 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  27.59 
 
 		 373 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  27.59 
 
 		 373 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  27.59 
 
 		 373 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>