156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2352 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 		 1181 aa  2386    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  45.48 
 
 		 1148 aa  940    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  48.93 
 
 		 1204 aa  1049    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1176 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  34.43 
 
 		 1171 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  34.49 
 
 		 1102 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  35.37 
 
 		 1175 aa  582  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  33.17 
 
 		 1220 aa  551  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  33.12 
 
 		 1205 aa  548  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  32.85 
 
 		 1211 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  31.52 
 
 		 1209 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  30.55 
 
 		 1199 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  31.52 
 
 		 1209 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  31.52 
 
 		 1209 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  31.52 
 
 		 1209 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  31.52 
 
 		 1209 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  31.82 
 
 		 1218 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  31.52 
 
 		 1209 aa  529  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  31.52 
 
 		 1209 aa  529  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  31.01 
 
 		 1182 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1208 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  31.02 
 
 		 1209 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  30.88 
 
 		 1209 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  30.68 
 
 		 1212 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  29.76 
 
 		 1172 aa  490  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  30.21 
 
 		 1157 aa  464  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1181 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  29.67 
 
 		 1207 aa  462  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  27.6 
 
 		 1164 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1173 aa  429  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  29.56 
 
 		 1173 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  30.96 
 
 		 1176 aa  422  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  30.23 
 
 		 1152 aa  419  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  28.62 
 
 		 1302 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  28.62 
 
 		 1302 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  28.62 
 
 		 1302 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  28.51 
 
 		 1329 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  29 
 
 		 1179 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  27.24 
 
 		 1268 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  28.53 
 
 		 1302 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  27.56 
 
 		 1302 aa  370  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  26.59 
 
 		 1302 aa  366  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1192 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  26.58 
 
 		 1348 aa  354  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1179 aa  350  6e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1168 aa  343  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  27.34 
 
 		 1289 aa  340  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  27.26 
 
 		 1289 aa  340  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  27.1 
 
 		 1289 aa  339  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1175 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  27.1 
 
 		 1289 aa  338  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1175 aa  334  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  25.23 
 
 		 1182 aa  331  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  28.63 
 
 		 1365 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  26.08 
 
 		 1194 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  24.63 
 
 		 1187 aa  301  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1332 aa  298  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1369 aa  296  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  26.87 
 
 		 1365 aa  297  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  25 
 
 		 1275 aa  296  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  25 
 
 		 1275 aa  296  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1195 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  25.82 
 
 		 1317 aa  283  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  26.19 
 
 		 1366 aa  282  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  25.83 
 
 		 1150 aa  278  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1164 aa  269  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  22.67 
 
 		 1164 aa  269  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1208 aa  263  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1270 aa  263  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  27.37 
 
 		 1358 aa  263  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  27.37 
 
 		 1358 aa  262  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  27.37 
 
 		 1358 aa  262  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  24.69 
 
 		 1194 aa  260  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  25.02 
 
 		 1177 aa  258  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  25.02 
 
 		 1177 aa  258  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  25.23 
 
 		 1288 aa  254  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  23.71 
 
 		 1165 aa  249  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  23.65 
 
 		 1165 aa  247  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  23.72 
 
 		 1165 aa  247  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1206 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1008 aa  246  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  24.91 
 
 		 1206 aa  244  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1315 aa  242  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  26.09 
 
 		 1205 aa  243  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  37.05 
 
 		 1230 aa  243  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  33.9 
 
 		 1314 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  33.9 
 
 		 1314 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  33.9 
 
 		 1314 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  33.9 
 
 		 1315 aa  238  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  34.76 
 
 		 1313 aa  238  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  33.9 
 
 		 1313 aa  237  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  33.9 
 
 		 1313 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  32.79 
 
 		 1301 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  33.26 
 
 		 1297 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  33.26 
 
 		 1297 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  33.26 
 
 		 1297 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  33.26 
 
 		 1297 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  33.26 
 
 		 1297 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  33.26 
 
 		 1297 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  33.26 
 
 		 1297 aa  234  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>