167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2319 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  53.63 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  43.9 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  49.53 
 
 
229 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  46.19 
 
 
230 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  48.58 
 
 
229 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  47.14 
 
 
224 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  46.97 
 
 
229 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  42.86 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  44.02 
 
 
233 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  44.44 
 
 
233 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  44.5 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  44.5 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  43.98 
 
 
227 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  42.16 
 
 
210 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  39.9 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  41.54 
 
 
204 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  41.15 
 
 
195 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  41.15 
 
 
195 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  37.7 
 
 
206 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  38.02 
 
 
221 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  33.33 
 
 
216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  34.87 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  32.79 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  35.42 
 
 
228 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  31.32 
 
 
264 aa  112  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  32.61 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  33.91 
 
 
224 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  36.27 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  33.16 
 
 
211 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  33.33 
 
 
222 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  35.98 
 
 
216 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2579  OmpW  33.5 
 
 
228 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.793769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  36.08 
 
 
198 aa  99.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  31.88 
 
 
215 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  33.51 
 
 
218 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  31.36 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  33.04 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  30.91 
 
 
214 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  30.91 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  30.91 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  30.91 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  30.91 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  30.91 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  37.89 
 
 
198 aa  95.5  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  35.85 
 
 
216 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  33.65 
 
 
213 aa  95.1  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  34.52 
 
 
219 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  34.13 
 
 
223 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  34.13 
 
 
212 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  34.13 
 
 
212 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  34.13 
 
 
212 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  34.87 
 
 
202 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  30.37 
 
 
218 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  34.3 
 
 
221 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  34.3 
 
 
213 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  32.3 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  33.63 
 
 
208 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  31.86 
 
 
208 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  30.29 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  30.29 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  34.68 
 
 
211 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  35.94 
 
 
196 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  34.1 
 
 
211 aa  89  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  34.1 
 
 
211 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  28.32 
 
 
214 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  30.81 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  34.21 
 
 
217 aa  85.9  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  31.28 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2085  OmpW family protein  29.26 
 
 
226 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  hitchhiker  0.00113092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1749  OmpW family protein  29.26 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  32.73 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  30.46 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  26.79 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  30.77 
 
 
251 aa  82  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  31.14 
 
 
215 aa  82  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  29.59 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  29.59 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  29.54 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  29.59 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1677  OmpW  30.91 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673806  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  33.33 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  30.26 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  35.71 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  28.7 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  33.33 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  30.1 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  30.1 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  30.1 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  30.1 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  30.1 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  30.1 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  31.44 
 
 
215 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  31.44 
 
 
215 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  29.38 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  29.29 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  28.9 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  28.9 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  31.14 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  33.97 
 
 
213 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>