More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2313 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2313  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 156 aa  314  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.019528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  72.19 
 
 		 157 aa  219  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  68.42 
 
 		 159 aa  206  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  67.31 
 
 		 159 aa  205  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  69.54 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  60.81 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1426  protein tyrosine phosphatase  62.09 
 
 		 157 aa  184  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1047  protein tyrosine phosphatase  61.84 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  61.22 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  62.5 
 
 		 161 aa  174  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3326  protein tyrosine phosphatase  61.59 
 
 		 157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4051  protein tyrosine phosphatase  61.74 
 
 		 157 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00946919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0815  protein tyrosine phosphatase  58.7 
 
 		 161 aa  163  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265223  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  55.7 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  51.03 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  47.47 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  49.33 
 
 		 160 aa  140  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  47.47 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  47.47 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  46.84 
 
 		 173 aa  137  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  49.01 
 
 		 166 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  46.2 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  43.05 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  47.44 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  45.75 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  44.9 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  48.99 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  49.32 
 
 		 151 aa  130  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.33 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.33 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.33 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.33 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  47.65 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.33 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.33 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.33 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  43.4 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  48.37 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  49.66 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46 
 
 		 159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  50.75 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  45.81 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  46.94 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  48.32 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  41.03 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  43.54 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  48.34 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  48.57 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  45.64 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  48.55 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  40.24 
 
 		 175 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  43.04 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  43.14 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  46.62 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  40.14 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  46.98 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  51.68 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  45.64 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  45.75 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  45.14 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  47.65 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  47.65 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  44 
 
 		 201 aa  120  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  45.89 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  43.33 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.9 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  46.31 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  41.29 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  44.08 
 
 		 182 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  41.22 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.62 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  46.05 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  40.94 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  40.94 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  45.75 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.19 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  39.19 
 
 		 157 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  42 
 
 		 154 aa  116  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  41.72 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  40.94 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  46.05 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.61 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  41.83 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  41.96 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>