More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2155 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 389 aa  792    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  68.41 
 
 		 402 aa  549  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  64.16 
 
 		 385 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  61.62 
 
 		 386 aa  485  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  62.6 
 
 		 386 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  61.32 
 
 		 386 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  61.46 
 
 		 385 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  60.26 
 
 		 385 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  61.21 
 
 		 392 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  60.53 
 
 		 398 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  60.21 
 
 		 390 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  57.66 
 
 		 393 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  57.66 
 
 		 401 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  60.42 
 
 		 398 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  57.7 
 
 		 409 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  60.16 
 
 		 405 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  57.4 
 
 		 400 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  58.09 
 
 		 385 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  58.09 
 
 		 404 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  59.26 
 
 		 387 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  58.42 
 
 		 381 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2941  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 		 391 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0027  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  60.26 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2537  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  61.32 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  51.42 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0204  coproporphyrinogen III oxidase  53.59 
 
 		 385 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  55.04 
 
 		 385 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  56.33 
 
 		 385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2870  coproporphyrinogen III oxidase  55.18 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0605644  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  53.11 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1224  coproporphyrinogen III oxidase  54.26 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2885  coproporphyrinogen III oxidase  54.01 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  54.74 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0013  coproporphyrinogen III oxidase  53.73 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  51.72 
 
 		 384 aa  368  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  51.99 
 
 		 414 aa  364  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  50.39 
 
 		 393 aa  365  1e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0258  coproporphyrinogen III oxidase  53.02 
 
 		 381 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  51.45 
 
 		 382 aa  347  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.55 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.1 
 
 		 393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.41 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.31 
 
 		 416 aa  277  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  41.55 
 
 		 399 aa  275  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.98 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  43.24 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  43.24 
 
 		 405 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  43.24 
 
 		 405 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  43.24 
 
 		 405 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  43.24 
 
 		 405 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  42.94 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  42.94 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.15 
 
 		 394 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  41.62 
 
 		 417 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  42.18 
 
 		 409 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  41.89 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  42.15 
 
 		 413 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  42.06 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  41.96 
 
 		 404 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  41.67 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  41.67 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  41.96 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  41.67 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.47 
 
 		 396 aa  262  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.16 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  41.67 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  41.37 
 
 		 404 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  41.37 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0479  coproporphyrinogen III oxidase  42.18 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3079  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  41.84 
 
 		 380 aa  257  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.862444  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  40.99 
 
 		 419 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  39.65 
 
 		 422 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.42 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.12 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4323  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.4 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  39.01 
 
 		 407 aa  253  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  39.71 
 
 		 408 aa  253  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.39 
 
 		 387 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0921  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 		 414 aa  253  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0856  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 		 414 aa  253  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.86 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  39.71 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2161  coproporphyrinogen III oxidase  40.23 
 
 		 424 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0050137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  39.94 
 
 		 385 aa  247  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  38.16 
 
 		 401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2448  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  40.76 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  39.71 
 
 		 386 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  39.94 
 
 		 422 aa  245  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  38.71 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0703  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.37 
 
 		 457 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.625393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  39.41 
 
 		 384 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  39.64 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5052  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  38.71 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  39.73 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  36.71 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03000  coproporphyrinogen III oxidase  41.79 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  38.38 
 
 		 385 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5151  coproporphyrinogen III oxidase  38.66 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.294445  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002450  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  37.68 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>