More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2039 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2039  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  100 
 
 
302 aa  619  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1845  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  80.92 
 
 
297 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6414  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  76.82 
 
 
301 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3721  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  75.83 
 
 
301 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0606642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5280  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  79.15 
 
 
297 aa  471  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5358  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  79.86 
 
 
297 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  78.8 
 
 
297 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124271  normal  0.0880049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.59 
 
 
312 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06071  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  76.92 
 
 
295 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.817258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1872  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  78.75 
 
 
296 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0543  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  76.92 
 
 
295 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0620  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  78.95 
 
 
295 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000136812  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05971  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  78.75 
 
 
296 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.848004  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05691  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  76.92 
 
 
295 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05991  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  76.92 
 
 
295 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05451  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  78.05 
 
 
296 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.240538  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0741  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  77.43 
 
 
296 aa  454  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3978  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  72.46 
 
 
312 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.475922  normal  0.178633 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  78.05 
 
 
296 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3537  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  75.44 
 
 
299 aa  448  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1621  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  76.31 
 
 
299 aa  441  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1316  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  75.58 
 
 
312 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  72.79 
 
 
312 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469245  hitchhiker  0.00416412 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0288  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  71.63 
 
 
297 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  71.63 
 
 
297 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0158  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  72.28 
 
 
319 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1007  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  70.93 
 
 
297 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1634  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  73.4 
 
 
301 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.948044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3478  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.73 
 
 
273 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1908  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.18 
 
 
273 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2386  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.11 
 
 
275 aa  269  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0217  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.29 
 
 
276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2258  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  50 
 
 
275 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00421326  normal  0.488321 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0326  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  50.19 
 
 
275 aa  267  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0117283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1538  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.43 
 
 
273 aa  267  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698797 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2027  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  49.44 
 
 
275 aa  265  5.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0592137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2192  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  50 
 
 
275 aa  262  6e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  49.82 
 
 
276 aa  259  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2375  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.37 
 
 
304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0791  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.75 
 
 
289 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0819  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.75 
 
 
289 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.147693  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1419  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.09 
 
 
286 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3939  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.99 
 
 
286 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2306  light-independent protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.61 
 
 
288 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2332  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.23 
 
 
307 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1532  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.71 
 
 
288 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.185742  normal  0.0569964 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  38.57 
 
 
292 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  41.18 
 
 
268 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  40.67 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  38.35 
 
 
313 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  40.67 
 
 
324 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  38.35 
 
 
292 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  40.22 
 
 
299 aa  179  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  40 
 
 
280 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  41.79 
 
 
731 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  36.2 
 
 
292 aa  176  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  39.19 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  37.83 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  40 
 
 
272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  35.84 
 
 
290 aa  170  3e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  40.15 
 
 
290 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  39.7 
 
 
272 aa  169  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  39.48 
 
 
273 aa  168  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  39.56 
 
 
270 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  41.54 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  39.48 
 
 
273 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0347  nitrogenase iron protein subunit NifH  33.94 
 
 
265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  38.6 
 
 
289 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1178  nitrogenase  33.96 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  37.78 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  36.86 
 
 
276 aa  162  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  39.26 
 
 
290 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  35.4 
 
 
276 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  39.63 
 
 
293 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1538  Nitrogenase  42.13 
 
 
259 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  36.4 
 
 
298 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  35.64 
 
 
296 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  39.84 
 
 
289 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  38.32 
 
 
295 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  37.73 
 
 
275 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  39.92 
 
 
289 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  39.08 
 
 
296 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  38.89 
 
 
289 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  38.46 
 
 
288 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  37.94 
 
 
300 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  37 
 
 
299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  37.94 
 
 
299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  37.94 
 
 
299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6225  nitrogenase reductase  39.27 
 
 
297 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.74 
 
 
289 aa  155  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  38.18 
 
 
292 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  39.29 
 
 
289 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  34.44 
 
 
284 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  35.66 
 
 
275 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  39.76 
 
 
288 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0408  nitrogenase  40.85 
 
 
254 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  35.06 
 
 
288 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  37.82 
 
 
298 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  37.96 
 
 
295 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  40.56 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>