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for query gene Msil_1980 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  56.48 
 
 
198 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
202 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
205 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  32.99 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
215 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
193 aa  125  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
196 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 
196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
212 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 
193 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 
209 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
212 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
212 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
211 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
186 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
212 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  32.77 
 
 
219 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
186 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
212 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
222 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  34.29 
 
 
209 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
209 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
191 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
190 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
212 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
176 aa  99.8  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  29.44 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
311 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  33.95 
 
 
194 aa  91.7  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  33.93 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
247 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  29.44 
 
 
222 aa  88.2  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  30.27 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
206 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  33.33 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 
199 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  29.61 
 
 
209 aa  84.7  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
211 aa  84  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  32.17 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5102  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  27.37 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal 
 
 
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NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  27.72 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal 
 
 
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NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  26.14 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal 
 
 
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