More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1920 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0830  ABC transporter related  78.83 
 
 
237 aa  329  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229113  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  73.87 
 
 
231 aa  323  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  72.4 
 
 
227 aa  320  1e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  72.32 
 
 
231 aa  320  1e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  72.85 
 
 
228 aa  320  1e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  69.87 
 
 
260 aa  316  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  69.87 
 
 
230 aa  316  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  70 
 
 
246 aa  312  3e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  70.05 
 
 
251 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  67.7 
 
 
247 aa  306  2e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  69.59 
 
 
240 aa  305  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  69.44 
 
 
235 aa  304  8e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  67.11 
 
 
246 aa  303  1e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  71.03 
 
 
241 aa  302  3e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  66.52 
 
 
242 aa  300  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  66.96 
 
 
242 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  66.96 
 
 
242 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  68 
 
 
239 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  65.16 
 
 
230 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  63.4 
 
 
235 aa  281  5e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  62.98 
 
 
235 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  66.37 
 
 
230 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  62.01 
 
 
234 aa  271  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  60.63 
 
 
252 aa  268  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  61.82 
 
 
230 aa  265  3e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  62.67 
 
 
233 aa  264  8e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3287  ABC transporter related  65.04 
 
 
229 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3602  ABC efflux transporter, ATPase subunit  64.6 
 
 
229 aa  261  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  58.88 
 
 
217 aa  261  8e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  56.19 
 
 
249 aa  259  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  60.83 
 
 
237 aa  258  5e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  65.15 
 
 
202 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2678  ABC transporter  65.02 
 
 
234 aa  256  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00869869  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  67.53 
 
 
211 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.603113  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  61.88 
 
 
228 aa  254  1e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3956  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  61.95 
 
 
229 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  62.5 
 
 
258 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0549  ABC transporter related  68.97 
 
 
174 aa  242  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  56.31 
 
 
227 aa  238  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  55.61 
 
 
227 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  55.61 
 
 
234 aa  234  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  52.21 
 
 
236 aa  232  4e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  51.35 
 
 
228 aa  228  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  59.8 
 
 
219 aa  228  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  52.47 
 
 
242 aa  225  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  52.44 
 
 
237 aa  225  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  52.47 
 
 
250 aa  225  5e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  53.37 
 
 
224 aa  225  5e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  52.29 
 
 
237 aa  224  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  50.67 
 
 
228 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  50.23 
 
 
238 aa  222  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.35 
 
 
228 aa  222  5e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.35 
 
 
228 aa  222  5e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  51.35 
 
 
228 aa  222  5e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  51.12 
 
 
224 aa  221  5e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.35 
 
 
228 aa  222  5e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  51.35 
 
 
228 aa  222  5e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  51.35 
 
 
228 aa  222  5e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.35 
 
 
228 aa  222  5e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.35 
 
 
228 aa  222  5e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.35 
 
 
228 aa  221  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  52.89 
 
 
237 aa  221  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  56.65 
 
 
219 aa  221  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  55.61 
 
 
226 aa  221  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  48.65 
 
 
228 aa  221  1e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  49.32 
 
 
242 aa  219  2e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  53.88 
 
 
224 aa  219  2e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  49.32 
 
 
242 aa  219  2e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  57.29 
 
 
239 aa  220  2e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  49.32 
 
 
246 aa  219  2e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1836  ABC transporter related  53.1 
 
 
233 aa  220  2e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  49.32 
 
 
242 aa  219  2e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  51.83 
 
 
230 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  50.23 
 
 
249 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
253 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  53.54 
 
 
233 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  50.23 
 
 
249 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 
228 aa  219  4e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  3.70874e-05 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  52.21 
 
 
237 aa  219  4e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  50.23 
 
 
249 aa  219  4e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1906  ABC transporter related  52.65 
 
 
233 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  52.47 
 
 
228 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  1.97884e-05 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  49.09 
 
 
224 aa  218  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  51.71 
 
 
238 aa  218  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  53.95 
 
 
227 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  9.39298e-11 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  51.79 
 
 
228 aa  218  8e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  52.23 
 
 
228 aa  218  9e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 
238 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 
238 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 
238 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 
238 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  49.55 
 
 
247 aa  217  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 
238 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.45 
 
 
228 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 
238 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.45 
 
 
228 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 
246 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  49.1 
 
 
246 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  51.6 
 
 
228 aa  216  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>