202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1899 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  100 
 
 
248 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  64.78 
 
 
257 aa  337  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  54.39 
 
 
255 aa  271  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  52.67 
 
 
244 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  53.09 
 
 
250 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  52.67 
 
 
250 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  54.92 
 
 
246 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  50.2 
 
 
259 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  50.63 
 
 
254 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  50.21 
 
 
254 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  55.36 
 
 
244 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  55.91 
 
 
248 aa  254  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  48.12 
 
 
246 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  49.79 
 
 
255 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  48.12 
 
 
257 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  47.7 
 
 
246 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  48.96 
 
 
252 aa  241  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  44.9 
 
 
253 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  45.45 
 
 
258 aa  221  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  46.12 
 
 
246 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  45.71 
 
 
258 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  46.15 
 
 
250 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  43.67 
 
 
259 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  43.44 
 
 
259 aa  208  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  45.91 
 
 
264 aa  205  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  45.37 
 
 
277 aa  204  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  44.86 
 
 
234 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  42.11 
 
 
262 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  42.11 
 
 
262 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  42.11 
 
 
262 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  44.34 
 
 
235 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  38.82 
 
 
244 aa  182  6e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  43.4 
 
 
255 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  38.8 
 
 
256 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  41.74 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  39.91 
 
 
248 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  38.36 
 
 
260 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  36.49 
 
 
256 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  32.62 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  24.55 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  28.47 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  24.55 
 
 
243 aa  60.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  31.14 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  27.47 
 
 
262 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  27.47 
 
 
257 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  25.71 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 
272 aa  55.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2400  hypothetical protein  24.05 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  26.57 
 
 
294 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  29.82 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  39.39 
 
 
278 aa  52  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  40 
 
 
196 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  40.58 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  30.7 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
810 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  25.97 
 
 
251 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  24.63 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
287 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  29.84 
 
 
240 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  26.43 
 
 
289 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  29.08 
 
 
245 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 
230 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  24.06 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  27.44 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  24.06 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.18 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  24.06 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  24.06 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  24.06 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  24.06 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  24.06 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  24.06 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  27.12 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  28.79 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.6 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1055  Methyltransferase type 11  39.68 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.83 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  28.04 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  32.88 
 
 
273 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  23.58 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  22.98 
 
 
246 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  25.95 
 
 
257 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  27.12 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  25.53 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0973939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>