More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1898 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
256 aa  516  1e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  69.53 
 
 
256 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.94 
 
 
255 aa  273  2e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  52.34 
 
 
255 aa  272  4e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  53.15 
 
 
255 aa  271  7e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.44 
 
 
256 aa  268  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.15 
 
 
255 aa  268  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.56 
 
 
255 aa  268  6e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.8 
 
 
282 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.57 
 
 
256 aa  266  3e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.52 
 
 
255 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.6 
 
 
260 aa  265  7e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  51.6 
 
 
257 aa  265  7e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.16 
 
 
255 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.78 
 
 
255 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.73 
 
 
255 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  51.17 
 
 
255 aa  258  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.4 
 
 
260 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  48.82 
 
 
256 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.03 
 
 
256 aa  254  1e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.22 
 
 
258 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.52 
 
 
256 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  50.8 
 
 
256 aa  248  9e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.02 
 
 
259 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.8 
 
 
256 aa  244  8e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.63 
 
 
259 aa  244  1e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.24 
 
 
259 aa  242  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.63 
 
 
255 aa  242  4e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.8 
 
 
278 aa  238  6e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  51.84 
 
 
255 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.43 
 
 
255 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.6 
 
 
256 aa  234  1e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  54.05 
 
 
227 aa  233  2e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.61 
 
 
256 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.82 
 
 
254 aa  228  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.8 
 
 
257 aa  225  5e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  46.69 
 
 
256 aa  225  5e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  44.84 
 
 
262 aa  219  4e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.39 
 
 
248 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.42 
 
 
258 aa  206  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.01 
 
 
259 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.9 
 
 
272 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.35 
 
 
259 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.82 
 
 
258 aa  202  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.82 
 
 
259 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.6 
 
 
271 aa  201  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.97 
 
 
257 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.75 
 
 
257 aa  200  1e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  43.78 
 
 
257 aa  200  2e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  46.34 
 
 
252 aa  199  4e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.61 
 
 
242 aa  197  1e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  44.19 
 
 
259 aa  197  2e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.18 
 
 
257 aa  197  2e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  47.19 
 
 
284 aa  197  2e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.21 
 
 
258 aa  197  2e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.39 
 
 
257 aa  196  4e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.94 
 
 
252 aa  196  4e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.42 
 
 
259 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.02 
 
 
259 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.09 
 
 
263 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.56 
 
 
248 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.13 
 
 
252 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.83 
 
 
258 aa  188  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.35 
 
 
250 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.32 
 
 
246 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.02 
 
 
266 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.73 
 
 
242 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.31 
 
 
259 aa  185  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.54 
 
 
267 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.13 
 
 
279 aa  184  1e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.32 
 
 
264 aa  184  2e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  41.13 
 
 
257 aa  184  2e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.13 
 
 
257 aa  184  2e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.16 
 
 
257 aa  182  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.8 
 
 
256 aa  182  5e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.51 
 
 
279 aa  182  5e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  41.41 
 
 
263 aa  182  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  42.68 
 
 
252 aa  181  9e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.87 
 
 
273 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.43e-05  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.95 
 
 
263 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.46 
 
 
259 aa  179  5e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.62 
 
 
256 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  41.57 
 
 
250 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.57 
 
 
250 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.13 
 
 
245 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  39.62 
 
 
267 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  9.87439e-07  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1257  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  38.06 
 
 
254 aa  175  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  44.19 
 
 
266 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.65 
 
 
257 aa  175  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1164  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.72 
 
 
260 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  2.29771e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.4 
 
 
256 aa  174  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  46.99 
 
 
255 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.49 
 
 
266 aa  174  1e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.7 
 
 
258 aa  174  1e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.02 
 
 
251 aa  173  2e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.84 
 
 
257 aa  174  2e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.37 
 
 
258 aa  174  2e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 
251 aa  173  2e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.97 
 
 
258 aa  173  3e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 
280 aa  172  3e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>