More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1853 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  36.02 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  35.44 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  27.7 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  33.97 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  32.9 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 322 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  41.51 
 
 		 291 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  32.54 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5912  AraC family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  28.35 
 
 		 331 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  33.08 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  32.12 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  35.66 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 223 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 327 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  32.33 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  40.71 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  32.04 
 
 		 180 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  28.26 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6198  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  39 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  33.57 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  38.83 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 409 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  38.83 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 409 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  28.27 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5487  transcriptional regulator, AraC family  32.19 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  38.38 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  27.02 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  40.22 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>