More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1680 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  71.55 
 
 
474 aa  682    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  70.09 
 
 
471 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  71.13 
 
 
474 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  75.16 
 
 
474 aa  716    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  68.79 
 
 
473 aa  671    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  69.21 
 
 
473 aa  676    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  69.56 
 
 
496 aa  676    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  69.34 
 
 
473 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  69.13 
 
 
473 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  72.09 
 
 
474 aa  688    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  74.73 
 
 
474 aa  716    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  68.08 
 
 
474 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  69.56 
 
 
473 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  69.13 
 
 
491 aa  674    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  68.01 
 
 
475 aa  654    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  77.97 
 
 
473 aa  754    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  76.02 
 
 
474 aa  723    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
473 aa  945    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  68.79 
 
 
473 aa  670    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  73.52 
 
 
475 aa  702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  71.76 
 
 
474 aa  682    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  62.66 
 
 
476 aa  632  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  62.82 
 
 
490 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  64.32 
 
 
474 aa  585  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  62.47 
 
 
468 aa  551  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  61.46 
 
 
490 aa  536  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  57.44 
 
 
487 aa  517  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 
466 aa  507  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 
466 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  55.18 
 
 
471 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 
471 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 
471 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 
468 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
470 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 
466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
479 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
471 aa  448  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
474 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
467 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
470 aa  432  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
466 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 
466 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 
466 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
466 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
472 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
465 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
472 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
470 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
469 aa  421  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
471 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
463 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
468 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
463 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
467 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
469 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
469 aa  409  1e-113  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
469 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
467 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
468 aa  411  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
463 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
463 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
470 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
464 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
469 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04820  glutamyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
467 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
469 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
469 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
463 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
472 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
467 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
463 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1209  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
467 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0142351 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
469 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
463 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
471 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
459 aa  392  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
469 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
479 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
459 aa  393  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
469 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
471 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
469 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
469 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
464 aa  395  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
471 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
462 aa  389  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
472 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
466 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
462 aa  389  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
469 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
477 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
471 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
504 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>