More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1670 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 494 aa  991    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.8 
 
 		 583 aa  360  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.7 
 
 		 587 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.46 
 
 		 607 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 		 606 aa  310  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 		 605 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 627 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.33 
 
 		 605 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.63 
 
 		 630 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.92 
 
 		 646 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  45.5 
 
 		 648 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 		 610 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.48 
 
 		 612 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 		 643 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 614 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 513 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  41.44 
 
 		 503 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 484 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  37.32 
 
 		 525 aa  229  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 548 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 614 aa  219  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  36.32 
 
 		 609 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  36.06 
 
 		 609 aa  216  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  36.78 
 
 		 599 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  46.55 
 
 		 771 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 769 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 562 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  38.92 
 
 		 513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  38.92 
 
 		 513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 661 aa  196  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  41.16 
 
 		 771 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  45.53 
 
 		 774 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 775 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 770 aa  193  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 512 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 778 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  39.33 
 
 		 513 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  40.41 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 511 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 772 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 617 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 505 aa  186  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 769 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 579 aa  186  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 774 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 911 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  42.79 
 
 		 790 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 769 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 		 468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  41.18 
 
 		 511 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 784 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  39.83 
 
 		 773 aa  182  8.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 844 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 717 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  46.52 
 
 		 508 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  41.05 
 
 		 783 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.99 
 
 		 1274 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 		 798 aa  182  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  41.05 
 
 		 783 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 511 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  31.98 
 
 		 1410 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  38.37 
 
 		 470 aa  179  7e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  42.26 
 
 		 288 aa  180  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 763 aa  179  9e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  41.18 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 779 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 536 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 530 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 533 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 1352 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 600 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 531 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  42.79 
 
 		 565 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 536 aa  177  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 530 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 1765 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1926  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 697 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 797 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 775 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 1276 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  34.35 
 
 		 576 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 1138 aa  173  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 		 764 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 646 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  42.86 
 
 		 576 aa  172  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  38.35 
 
 		 736 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  36.64 
 
 		 532 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 1296 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 882 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 		 645 aa  171  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 1768 aa  170  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 795 aa  169  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>