More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1640 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  74 
 
 		 157 aa  239  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 153 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 153 aa  210  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  64.67 
 
 		 153 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 153 aa  207  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  49.36 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  49.36 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  46.75 
 
 		 154 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  48.08 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 152 aa  157  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 152 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 152 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 152 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 155 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 155 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 156 aa  155  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  49.33 
 
 		 152 aa  153  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  50.99 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  48 
 
 		 152 aa  150  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  47.33 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  50.66 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 158 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  46.71 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  48.67 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  48.67 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 202 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 202 aa  147  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  48.67 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  48.67 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  48.67 
 
 		 229 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 175 aa  147  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 157 aa  146  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  48 
 
 		 229 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 175 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  47.33 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  47.33 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  47.33 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  47.06 
 
 		 161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  46.05 
 
 		 157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 161 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  45.39 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  41.06 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  41.06 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  41.72 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  42.42 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 		 168 aa  140  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 		 168 aa  140  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 171 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 174 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 175 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.06 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 174 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 218 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 174 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 174 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>