295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1624 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1624  beta-lactamase  100 
 
 		 397 aa  795    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000378286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.37 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  28.79 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.25 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  27.27 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  27.09 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  24.04 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  24.5 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.3 
 
 		 489 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  27.8 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  28.24 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.15 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  24.71 
 
 		 591 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  27.98 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  26.88 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.32 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  27.52 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  27.52 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  27.52 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  27.52 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  27.52 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  27.52 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  27.52 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  28.27 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  27.52 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  27.52 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  26.35 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  25.4 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  26.35 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  26.35 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  27.47 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  26.87 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  26.84 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  26.51 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  26.87 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  25.93 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  26.87 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  27.09 
 
 		 550 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  26.09 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  25 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.43 
 
 		 595 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  26.07 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  28.67 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  25.88 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  26.51 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.22 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  25.66 
 
 		 463 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  27.08 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  27.06 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  26.95 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  25.18 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  28.71 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  29.24 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  24.51 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  25.91 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  24.76 
 
 		 822 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  22.44 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.4 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  27.27 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  26.69 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  28.62 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  24.51 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  26.24 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  26.34 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  24.11 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  28.62 
 
 		 559 aa  60.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.75 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  28.95 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  29.26 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  28.47 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  26.25 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  26.25 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  26.32 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  25.84 
 
 		 501 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  26.64 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  27.42 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0126  beta-lactamase  27.8 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  26.01 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  23.31 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29.04 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  30.38 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  27.42 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  27.18 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  27.64 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  30.63 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  26.47 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  26.71 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  24.92 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  27.69 
 
 		 2457 aa  58.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  28.23 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  28.57 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  25.6 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  27.56 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  25.15 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  26.17 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  27.04 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>