More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1513 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  47.59 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  54.6 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  54.49 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  56.36 
 
 		 178 aa  156  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  51.65 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  38.51 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  39.01 
 
 		 201 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  38.33 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  37.43 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  40.11 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  41.57 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  42.17 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  34.43 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  32.8 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  32.28 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  35.33 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  32.28 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  40.49 
 
 		 234 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  37.57 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  36.61 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  36.26 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  43.09 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  40.12 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  35.87 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  35.68 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  36.41 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  36.41 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  33.69 
 
 		 199 aa  99  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  42.86 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  38.71 
 
 		 224 aa  99  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  34.59 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  37.57 
 
 		 208 aa  98.6  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  32.8 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  36.07 
 
 		 229 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  37.1 
 
 		 214 aa  97.8  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  36.07 
 
 		 229 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  36.61 
 
 		 229 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  33.69 
 
 		 226 aa  97.4  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  35.63 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  33.15 
 
 		 205 aa  95.5  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  34.24 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  34.76 
 
 		 209 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  32.8 
 
 		 201 aa  94.4  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  34.76 
 
 		 209 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  34.76 
 
 		 209 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  33.87 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  34.24 
 
 		 243 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  33.89 
 
 		 209 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  33.91 
 
 		 825 aa  92.8  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  38.89 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  35.33 
 
 		 225 aa  92  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.33 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  34.25 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.33 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  32.78 
 
 		 202 aa  91.3  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  37.82 
 
 		 204 aa  90.9  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  31.72 
 
 		 211 aa  90.9  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  36.81 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  36.81 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  36.81 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  32.78 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  32.78 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  33.89 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  32.78 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  29.65 
 
 		 234 aa  87.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  29.19 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  29.15 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  35.4 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  29.15 
 
 		 235 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  33.33 
 
 		 819 aa  85.9  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  31.44 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  35.56 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  36.88 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  31.07 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  31.91 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  38.17 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  25.68 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  31.43 
 
 		 827 aa  80.1  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  33.9 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  34.27 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  32.39 
 
 		 950 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  32.39 
 
 		 974 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  32.39 
 
 		 962 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  32.8 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  31.61 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  30.41 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  32.76 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  31.52 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  34.22 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  29.9 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  29.51 
 
 		 832 aa  74.3  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  28.34 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  29.02 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  31.28 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  28.36 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  31.44 
 
 		 244 aa  72  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0222  cytochrome c oxidase, subunit III  29.73 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>