More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1438 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 447 aa  851    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  51.82 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  52.88 
 
 		 401 aa  325  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  46.41 
 
 		 393 aa  325  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  47.04 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  47.04 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  50.77 
 
 		 402 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  49.21 
 
 		 398 aa  302  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  50.84 
 
 		 396 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  50.78 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 405 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 405 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 405 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  51.15 
 
 		 408 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 395 aa  276  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  47.45 
 
 		 413 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  46.86 
 
 		 406 aa  273  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  41.98 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  44.24 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  44.8 
 
 		 398 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  46.52 
 
 		 405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  44.17 
 
 		 400 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  43.54 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  44.17 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  36.91 
 
 		 406 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  36.91 
 
 		 406 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  36.91 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  35.49 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 388 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 416 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  47.86 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  45.97 
 
 		 401 aa  229  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 399 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  44.41 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  42.93 
 
 		 399 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 		 397 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 399 aa  216  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  45.4 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  44.3 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  44.07 
 
 		 423 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 413 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 383 aa  209  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 433 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 394 aa  209  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 399 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  39.52 
 
 		 411 aa  209  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 404 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  38.4 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  38.4 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  38.4 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 391 aa  203  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 405 aa  203  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 405 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  41.55 
 
 		 422 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  38.66 
 
 		 394 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 419 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  38.14 
 
 		 394 aa  200  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  40.65 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 		 399 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 419 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  41.86 
 
 		 410 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  39.31 
 
 		 399 aa  196  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  38.66 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  38.66 
 
 		 394 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  38.66 
 
 		 394 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  38.66 
 
 		 394 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 408 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 396 aa  193  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 401 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>