More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1434 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  66.62 
 
 		 682 aa  907    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  56.06 
 
 		 623 aa  716    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1434  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 679 aa  1383    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0420  excinuclease ABC subunit C  54.2 
 
 		 620 aa  671    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000882939  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  63.83 
 
 		 674 aa  819    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  63.61 
 
 		 690 aa  824    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1232  excinuclease ABC subunit C  61.86 
 
 		 680 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  66.17 
 
 		 682 aa  903    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2526  excinuclease ABC subunit C  61.15 
 
 		 666 aa  783    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  63.77 
 
 		 691 aa  837    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  56.22 
 
 		 623 aa  717    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  52.41 
 
 		 642 aa  653    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  57.46 
 
 		 658 aa  759    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1728  excinuclease ABC subunit C  59.77 
 
 		 688 aa  795    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  60.73 
 
 		 704 aa  806    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  51.85 
 
 		 639 aa  678    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  60.42 
 
 		 644 aa  776    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  60.18 
 
 		 695 aa  822    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  55.38 
 
 		 631 aa  710    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0901  excinuclease ABC subunit C  60.37 
 
 		 699 aa  807    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.686054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  63.88 
 
 		 688 aa  886    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1712  excinuclease ABC, C subunit  75 
 
 		 692 aa  1009    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2652  excinuclease ABC, C subunit  67.56 
 
 		 668 aa  863    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  59.42 
 
 		 695 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  59.32 
 
 		 690 aa  801    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  57.95 
 
 		 634 aa  752    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  63.61 
 
 		 690 aa  825    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  53.44 
 
 		 635 aa  697    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  50.85 
 
 		 644 aa  654    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  62.75 
 
 		 653 aa  845    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  56.98 
 
 		 631 aa  726    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  65.73 
 
 		 700 aa  897    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  56.26 
 
 		 633 aa  730    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  55.85 
 
 		 623 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  61.53 
 
 		 690 aa  799    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3713  excinuclease ABC, C subunit  65.21 
 
 		 668 aa  860    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  52.86 
 
 		 629 aa  674    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2344  excinuclease ABC, C subunit  70.12 
 
 		 779 aa  707    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.77277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2312  excinuclease ABC subunit C  55.7 
 
 		 623 aa  691    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  61.86 
 
 		 680 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  49.6 
 
 		 658 aa  599  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  44.03 
 
 		 611 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  44.32 
 
 		 609 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  41.29 
 
 		 613 aa  476  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 599 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  42.22 
 
 		 617 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  42.65 
 
 		 607 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  40.87 
 
 		 626 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  41.04 
 
 		 621 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 		 599 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  41.04 
 
 		 627 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  40.63 
 
 		 657 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  40.49 
 
 		 608 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  40.49 
 
 		 623 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  41.21 
 
 		 618 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  41.84 
 
 		 603 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  40.46 
 
 		 607 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  39.8 
 
 		 607 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  40.06 
 
 		 608 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  39.9 
 
 		 608 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  37.62 
 
 		 613 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  41.86 
 
 		 614 aa  441  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 		 607 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  40.3 
 
 		 607 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  39.35 
 
 		 610 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  40.03 
 
 		 607 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 610 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  39.52 
 
 		 610 aa  435  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 610 aa  433  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 610 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  39.47 
 
 		 607 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 610 aa  431  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 610 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  39.97 
 
 		 598 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1608  excinuclease ABC subunit C  38.87 
 
 		 606 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00130294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  39.47 
 
 		 607 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  39.14 
 
 		 607 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 610 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  39.13 
 
 		 610 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 610 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 612 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 610 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 		 674 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3270  excinuclease ABC subunit C  36.58 
 
 		 639 aa  425  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150435  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  39.13 
 
 		 617 aa  425  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 610 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  39.52 
 
 		 673 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  39.71 
 
 		 619 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  39.13 
 
 		 610 aa  425  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 610 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  37.1 
 
 		 609 aa  423  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  38.97 
 
 		 617 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  39.23 
 
 		 609 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  39.5 
 
 		 588 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  39.52 
 
 		 610 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  37.58 
 
 		 609 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  39.28 
 
 		 605 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  39.14 
 
 		 607 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  36.46 
 
 		 684 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1023  excinuclease ABC subunit C  36.61 
 
 		 684 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>