280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1414 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 339 aa  673    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  63.5 
 
 		 337 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  52.92 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  54.07 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  54.07 
 
 		 334 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  51.65 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  51.98 
 
 		 338 aa  322  5e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  53.66 
 
 		 324 aa  315  6e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  52.29 
 
 		 338 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  52.98 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  53.68 
 
 		 338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  54.66 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  50.76 
 
 		 338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  53.29 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  51.37 
 
 		 325 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  52.15 
 
 		 325 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  51.07 
 
 		 346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  48.29 
 
 		 316 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  51.53 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  50.94 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  47.94 
 
 		 330 aa  292  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  37.87 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  37.87 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  38.25 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  35.23 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  35.51 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 378 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  37.88 
 
 		 374 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2464  FAD dependent oxidoreductase  40.18 
 
 		 358 aa  202  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  39 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0163  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 410 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 		 376 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0206  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 402 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  38.37 
 
 		 376 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 		 386 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 381 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 		 378 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  36.31 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  38.76 
 
 		 377 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 		 378 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  40.44 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  38.62 
 
 		 372 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.99 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 		 378 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  40.36 
 
 		 378 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  40.06 
 
 		 378 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3739  glycine oxidase ThiO  36.61 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2730  oxidoreductase, FAD-binding  36.61 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3710  oxidoreductase, FAD-binding  36.61 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1773  glycine oxidase ThiO  36.61 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3681  glycine oxidase ThiO  36.61 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2780  glycine oxidase ThiO  36.61 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3224  glycine oxidase ThiO  36.61 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  31.02 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  34.02 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  33.04 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  35.24 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  31.44 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  37.12 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  35.48 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  33.43 
 
 		 375 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  31.55 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  32.29 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  31.56 
 
 		 392 aa  99.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  35.65 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  30.47 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  35.65 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  35.65 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  30.9 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  32.15 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.9 
 
 		 382 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.85 
 
 		 405 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  31.67 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  30.95 
 
 		 440 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  30.47 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.1 
 
 		 376 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  28.81 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  29.86 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  30.54 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  28.69 
 
 		 404 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  30.56 
 
 		 368 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.91 
 
 		 375 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  31.06 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  31.12 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  30.66 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  23.96 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  27.9 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>