More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1251 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  100 
 
 		 473 aa  954    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  67.75 
 
 		 471 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  65.37 
 
 		 471 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  65.37 
 
 		 471 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  66.16 
 
 		 470 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  61.56 
 
 		 470 aa  578  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  62.04 
 
 		 470 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  61.77 
 
 		 470 aa  581  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  61.34 
 
 		 470 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  60.3 
 
 		 463 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  62.01 
 
 		 472 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  60.3 
 
 		 463 aa  568  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  59.65 
 
 		 468 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  60.65 
 
 		 465 aa  561  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  61.14 
 
 		 472 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  59.78 
 
 		 471 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  60.7 
 
 		 472 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  59.02 
 
 		 472 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  60 
 
 		 471 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  58.56 
 
 		 474 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  60.48 
 
 		 472 aa  550  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  60.04 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  59.69 
 
 		 476 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  59.15 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  58.87 
 
 		 461 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  58.23 
 
 		 461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  58.01 
 
 		 461 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  55.17 
 
 		 463 aa  501  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  55.17 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  55.91 
 
 		 463 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  56.51 
 
 		 435 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  56.96 
 
 		 462 aa  497  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  52.28 
 
 		 469 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  52.28 
 
 		 469 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  52.28 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  52.49 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  52.06 
 
 		 469 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  52.06 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  51.41 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  51.63 
 
 		 469 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  52.28 
 
 		 469 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  50 
 
 		 461 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  50.54 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  54.23 
 
 		 470 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  51.75 
 
 		 465 aa  478  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  52.06 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  52.16 
 
 		 466 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  53.68 
 
 		 466 aa  471  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  51.82 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  54.11 
 
 		 465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  52.49 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  50.85 
 
 		 465 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  49.89 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  49.04 
 
 		 459 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  45.89 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  48.38 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  51.08 
 
 		 467 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  46.57 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  46.32 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  46.55 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  45.14 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  46.98 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  45.77 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  45.34 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  46.54 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  39.96 
 
 		 511 aa  352  8.999999999999999e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  41.06 
 
 		 504 aa  349  6e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  42.86 
 
 		 472 aa  346  5e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  41.67 
 
 		 475 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  41.67 
 
 		 475 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  40.35 
 
 		 517 aa  341  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  42.31 
 
 		 470 aa  339  7e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  40.36 
 
 		 547 aa  338  8e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  40.8 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  40.8 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1992  threonine synthase  41.16 
 
 		 482 aa  334  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  40.94 
 
 		 477 aa  333  6e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  40.58 
 
 		 475 aa  330  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  39.25 
 
 		 476 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1965  threonine synthase  41.04 
 
 		 481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000623225  normal  0.345947 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  40.76 
 
 		 476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  40.76 
 
 		 476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  41.47 
 
 		 475 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  39.33 
 
 		 476 aa  323  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  41.06 
 
 		 471 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  40.5 
 
 		 475 aa  322  7e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  41.46 
 
 		 498 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000457965  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2573  threonine synthase  40.5 
 
 		 487 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.866855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  38.58 
 
 		 500 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  40.46 
 
 		 480 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  38.08 
 
 		 499 aa  316  6e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  42.05 
 
 		 500 aa  315  9e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  39.37 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2664  threonine synthase  39.8 
 
 		 516 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  39.38 
 
 		 475 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  37.95 
 
 		 499 aa  312  9e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  39.09 
 
 		 499 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1328  threonine synthase  39.58 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  39.38 
 
 		 480 aa  309  5.9999999999999995e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0446  threonine synthase  39.17 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.31582  normal  0.521575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>