More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1203 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 294 aa  585  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  84.93 
 
 		 305 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0013  acetylglutamate kinase  75.34 
 
 		 302 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0868  acetylglutamate kinase  71.08 
 
 		 304 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1384  acetylglutamate kinase  71.43 
 
 		 304 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971931  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2342  acetylglutamate kinase  72.13 
 
 		 298 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791434  normal  0.660777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2621  acetylglutamate kinase  72.13 
 
 		 298 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0814  acetylglutamate kinase  67.88 
 
 		 298 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0072  acetylglutamate kinase  70.14 
 
 		 298 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00499393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0633  acetylglutamate kinase  69.44 
 
 		 298 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3071  acetylglutamate kinase  69.44 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0680  acetylglutamate kinase  70.14 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3700  acetylglutamate kinase  70.14 
 
 		 298 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2297  acetylglutamate kinase  71.43 
 
 		 298 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  68.48 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7329  acetylglutamate kinase  69.79 
 
 		 298 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0954  acetylglutamate kinase  68.47 
 
 		 297 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.576098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  63.23 
 
 		 295 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  64.48 
 
 		 295 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  62.75 
 
 		 301 aa  368  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  62.89 
 
 		 295 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  63.45 
 
 		 295 aa  364  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1358  acetylglutamate kinase  66.21 
 
 		 296 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1025  acetylglutamate kinase  65.87 
 
 		 296 aa  362  4e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0966  acetylglutamate kinase  65.87 
 
 		 296 aa  362  4e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0297  acetylglutamate kinase  61.79 
 
 		 304 aa  346  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  58.97 
 
 		 303 aa  336  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2910  acetylglutamate kinase  61.05 
 
 		 301 aa  322  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  58.16 
 
 		 336 aa  322  6e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  55.36 
 
 		 313 aa  314  9e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3095  acetylglutamate kinase  59.93 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3341  acetylglutamate kinase  59.65 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  55.23 
 
 		 293 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  55.23 
 
 		 293 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  52.9 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4558  acetylglutamate kinase  54.55 
 
 		 304 aa  297  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  54.51 
 
 		 292 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 		 292 aa  291  7e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0324  acetylglutamate kinase  56.07 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.491958 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  49.48 
 
 		 290 aa  288  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  49.48 
 
 		 290 aa  288  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  50.52 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  49.3 
 
 		 291 aa  285  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  48.26 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  50.69 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  49.13 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0301  acetylglutamate kinase  53.96 
 
 		 286 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.84379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  46.85 
 
 		 294 aa  278  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  49.48 
 
 		 295 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  46.76 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  48.08 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  46.62 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  48.28 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  49.66 
 
 		 300 aa  276  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  49.32 
 
 		 295 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  50.18 
 
 		 287 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  48.1 
 
 		 292 aa  275  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0880  acetylglutamate kinase  53.43 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00277635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  46.55 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  48.1 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  48.33 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  47.08 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  50.86 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  47.74 
 
 		 293 aa  272  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  48.76 
 
 		 301 aa  271  9e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  48.45 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  47.75 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  45.52 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  46.62 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  50.52 
 
 		 296 aa  269  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  46.28 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  46.28 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  46.28 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  46.74 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  47.57 
 
 		 293 aa  269  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  48.24 
 
 		 297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  47.33 
 
 		 280 aa  268  5.9999999999999995e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  48.94 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  45.95 
 
 		 301 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  46.5 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  46.85 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1101  acetylglutamate kinase  49.3 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.419485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  45.76 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  47.54 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  45.27 
 
 		 301 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2015  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 295 aa  266  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000238351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 		 299 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  48.94 
 
 		 281 aa  266  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  45.42 
 
 		 301 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  45.42 
 
 		 301 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  45.61 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  45.61 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  47.87 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  45.92 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  48.94 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  46.83 
 
 		 305 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3524  acetylglutamate kinase  47.18 
 
 		 296 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  48.48 
 
 		 298 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  45.21 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>