More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1201 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  55.68 
 
 		 624 aa  692    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.16 
 
 		 607 aa  645    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  54.62 
 
 		 616 aa  680    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  55.36 
 
 		 614 aa  691    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  56.25 
 
 		 605 aa  687    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.99 
 
 		 597 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.28 
 
 		 614 aa  687    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.18 
 
 		 621 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.93 
 
 		 622 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  56.98 
 
 		 616 aa  728    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.07 
 
 		 629 aa  677    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  53.75 
 
 		 616 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.21 
 
 		 632 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.31 
 
 		 621 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.26 
 
 		 609 aa  681    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  69.41 
 
 		 604 aa  867    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.53 
 
 		 609 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  55.83 
 
 		 617 aa  685    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 600 aa  1231    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.67 
 
 		 610 aa  629  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.57 
 
 		 597 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.27 
 
 		 610 aa  628  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  53.4 
 
 		 609 aa  627  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.97 
 
 		 597 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.45 
 
 		 620 aa  592  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.24 
 
 		 595 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.96 
 
 		 612 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.85 
 
 		 628 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  45.33 
 
 		 592 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.03 
 
 		 623 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.13 
 
 		 623 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  46 
 
 		 606 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.69 
 
 		 608 aa  514  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.57 
 
 		 630 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  45.25 
 
 		 589 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.83 
 
 		 635 aa  502  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.09 
 
 		 626 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.27 
 
 		 577 aa  487  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.85 
 
 		 584 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.1 
 
 		 600 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  41.65 
 
 		 601 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.16 
 
 		 579 aa  421  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.09 
 
 		 569 aa  411  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.9 
 
 		 579 aa  402  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  35.97 
 
 		 566 aa  367  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  34.06 
 
 		 556 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  33.85 
 
 		 542 aa  280  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.41 
 
 		 567 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.6 
 
 		 575 aa  277  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  35.52 
 
 		 559 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  31.37 
 
 		 570 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  32.37 
 
 		 551 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.06 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.78 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.59 
 
 		 554 aa  262  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  33.01 
 
 		 552 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.33 
 
 		 550 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  31.66 
 
 		 557 aa  260  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  31.21 
 
 		 528 aa  258  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.8 
 
 		 541 aa  258  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  31.39 
 
 		 541 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  31.39 
 
 		 541 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  31.39 
 
 		 541 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  31.39 
 
 		 541 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  31.47 
 
 		 536 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.29 
 
 		 560 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.29 
 
 		 560 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.29 
 
 		 560 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.72 
 
 		 552 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  31.72 
 
 		 541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.72 
 
 		 552 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  39.23 
 
 		 562 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.07 
 
 		 541 aa  253  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.46 
 
 		 563 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  34.26 
 
 		 541 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.2 
 
 		 548 aa  253  8.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.14 
 
 		 558 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.14 
 
 		 558 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.14 
 
 		 558 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.27 
 
 		 555 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.14 
 
 		 558 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  31.55 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.77 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  31.17 
 
 		 541 aa  253  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.14 
 
 		 558 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.14 
 
 		 558 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.14 
 
 		 558 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.22 
 
 		 557 aa  252  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  31.48 
 
 		 552 aa  252  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.13 
 
 		 560 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.77 
 
 		 554 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.54 
 
 		 560 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  31.41 
 
 		 530 aa  250  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.29 
 
 		 555 aa  250  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  31.67 
 
 		 542 aa  249  8e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.07 
 
 		 555 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.62 
 
 		 557 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  31.3 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.07 
 
 		 553 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.07 
 
 		 552 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>