179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1197 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1197  CbbX protein  100 
 
 		 307 aa  629  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1749  CbbX protein  70.03 
 
 		 308 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1329  AAA ATPase, central region  69.87 
 
 		 306 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6395  CbbX-like protein  69.13 
 
 		 310 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3720  AAA ATPase, central region  69.93 
 
 		 307 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  hitchhiker  0.00179613 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3926  CbxX/CfqX monofunctional  73.78 
 
 		 311 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3962  AAA ATPase-like  70.27 
 
 		 306 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157351 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4051  AAA ATPase, central region  69.58 
 
 		 304 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3749  AAA ATPase, central region  69.58 
 
 		 304 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225379  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2927  CbbX like protein  69.23 
 
 		 304 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1701  ATPase central domain-containing protein  71.23 
 
 		 308 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0826  ATPase central domain-containing protein  69.66 
 
 		 306 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0453  CbbX-like protein  70.73 
 
 		 334 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1280  CbbX protein  68.94 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0684  AAA ATPase, central region  67.91 
 
 		 320 aa  407  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2939  ATPase central domain-containing protein  68.6 
 
 		 309 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.949786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2710  ATPase central domain-containing protein  68.84 
 
 		 309 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.947167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0331  AAA ATPase  65.46 
 
 		 320 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000626535  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3030  CbbX protein  68.57 
 
 		 310 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00687874  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2784  AAA type ATPase  69.18 
 
 		 298 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0763  ATPase  65.97 
 
 		 301 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1480  AAA type ATPase  69.4 
 
 		 318 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2451  CbbX-like protein, putative AAA ATPase  66.12 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.349953 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1603  ATPase  64.24 
 
 		 301 aa  381  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6495  CbbX protein  67.59 
 
 		 329 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3253  phosphoribulokinase/uridine kinase  66.9 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1916  CbxX/CfqX monofunctional  67.82 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.931527 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08171  RuBisCo-expression protein CbbX  63.19 
 
 		 305 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1657  CbbX protein  67.48 
 
 		 323 aa  364  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0636  AAA ATPase central domain-containing protein  58.8 
 
 		 312 aa  349  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.356412  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42728  predicted protein  57.54 
 
 		 505 aa  327  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1566  AAA ATPase central domain protein  48.69 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.201221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1880  ATPase central domain-containing protein  45.83 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00868854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0983  hypothetical protein  45.83 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00278176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2725  AAA ATPase central domain protein  44.44 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00914326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1619  ATPase central domain-containing protein  45.28 
 
 		 298 aa  222  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.684878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2132  AAA ATPase central domain protein  45.69 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.474775  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1118  AAA ATPase  42.42 
 
 		 331 aa  218  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000607625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11610  AAA ATPase central domain protein  42.01 
 
 		 348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4389  ATPase central domain-containing protein  44.9 
 
 		 466 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1502  AAA ATPase central domain protein  44.4 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000852955 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17420  AAA+ family ATPase  46.38 
 
 		 466 aa  213  3.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.131578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1224  stage V sporulation protein K  44.4 
 
 		 310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000254018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3737  stage V sporulation protein K  40.74 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3467  stage V sporulation protein K  40.74 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3760  stage V sporulation protein K  40.74 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3555  stage V sporulation protein K  40.74 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3454  stage V sporulation protein K  40.74 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3719  stage V sporulation protein K  40.74 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0200700000000003e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3839  stage V sporulation protein K  40.74 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2104  stage V sporulation protein K  43.63 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3475  sporulation stage V protein K  40.74 
 
 		 318 aa  205  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0352307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3809  stage V sporulation protein K  40.74 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1496  stage V sporulation protein K  40.74 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0780968  normal  0.0751264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3309  AAA ATPase central domain protein  43.55 
 
 		 617 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  43.37 
 
 		 1930 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3584  AAA ATPase central domain protein  42.35 
 
 		 678 aa  198  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.883196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0226  AAA ATPase central domain protein  43.38 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4841  ATPase central domain-containing protein  39.45 
 
 		 1105 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585558  hitchhiker  0.0091693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12600  AAA+ family ATPase  44.49 
 
 		 681 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37602  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2387  sporulation stage V protein K  40.89 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  42.7 
 
 		 855 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1867  ATPase central domain-containing protein  42.8 
 
 		 344 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0460326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1988  ATPase central domain-containing protein  38.83 
 
 		 664 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2862  AAA ATPase central domain protein  44.44 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1283  AAA ATPase central domain protein  41.28 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1312  AAA ATPase central domain protein  41.28 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3060  AAA ATPase central domain protein  42.71 
 
 		 541 aa  189  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283109 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2067  ATPases of the AAA+ class-like protein  39.27 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7100  ATPase central domain-containing protein  37.72 
 
 		 780 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6840  ATPase central domain-containing protein  43.56 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  41.18 
 
 		 839 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4241  AAA ATPase, central region  37.67 
 
 		 390 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.434554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3526  AAA ATPase central domain protein  46.81 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1396  AAA ATPase central domain protein  46.81 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0170  stage V sporulation protein K  39.48 
 
 		 550 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.129019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1071  ATPase central domain-containing protein  40.29 
 
 		 596 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2403  AAA ATPase central domain-containing protein  40.22 
 
 		 779 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4249  AAA ATPase, central region  40.08 
 
 		 846 aa  179  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0467  ATPase central domain-containing protein  39.63 
 
 		 564 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.12935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1455  ATPase central domain-containing protein  39.51 
 
 		 653 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.183766  hitchhiker  0.0000524636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1454  ATPase central domain-containing protein  40.15 
 
 		 366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1627  AAA ATPase central domain protein  39.43 
 
 		 1110 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.856063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0029  AAA+ class-like ATPase  37.2 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.509013  hitchhiker  0.00474583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3318  AAA ATPase central domain protein  38.52 
 
 		 823 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.488425  normal  0.919341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13903  hypothetical protein  39.71 
 
 		 573 aa  166  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0394  AAA ATPase central domain protein  43.17 
 
 		 558 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0521615  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2144  ATPase  38.24 
 
 		 802 aa  158  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1592  AAA ATPase central domain protein  44.1 
 
 		 819 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00365213  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0773  ATPase central domain-containing protein  42.79 
 
 		 574 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10289  hypothetical protein  37.59 
 
 		 631 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000685477  normal  0.631153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0936  AAA ATPase central domain protein  36.88 
 
 		 591 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5463  ATPase central domain-containing protein  36.9 
 
 		 599 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1517  spoVK domain-containing protein  34.57 
 
 		 1133 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.885165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0370  AAA ATPase, central region  36.82 
 
 		 594 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0380  ATPase central domain-containing protein  36.82 
 
 		 594 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0329  ATPase central domain-containing protein  38.52 
 
 		 616 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0054  ATPase central domain-containing protein  41.67 
 
 		 573 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0220398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0064  AAA ATPase, central region  41.67 
 
 		 573 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0073  ATPase central domain-containing protein  41.67 
 
 		 573 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183052  normal  0.153807 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>