More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1165 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  100 
 
 		 335 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  68.67 
 
 		 333 aa  443  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  62.05 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  63.25 
 
 		 333 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  63.33 
 
 		 333 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  63.86 
 
 		 333 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  59.82 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  62.35 
 
 		 333 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  62.65 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  60.9 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  60.9 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  61.49 
 
 		 337 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  61.35 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  59.7 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  59.82 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  60.74 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  53.82 
 
 		 330 aa  361  9e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  54.29 
 
 		 330 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  54.29 
 
 		 330 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  57.14 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  52.91 
 
 		 331 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  55.05 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  56.66 
 
 		 337 aa  346  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  55 
 
 		 328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  51.38 
 
 		 330 aa  342  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  51.99 
 
 		 330 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  52.94 
 
 		 332 aa  338  9e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  51.68 
 
 		 330 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  51.7 
 
 		 342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  50.76 
 
 		 338 aa  325  9e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  53.37 
 
 		 329 aa  322  8e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  52.91 
 
 		 337 aa  315  8e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  51.06 
 
 		 338 aa  315  8e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  56.15 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  53.52 
 
 		 331 aa  308  6.999999999999999e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  50.6 
 
 		 338 aa  308  9e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  46.08 
 
 		 335 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  46.71 
 
 		 335 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  45.57 
 
 		 348 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  42.01 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  42.37 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  42.06 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  40.31 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  45.59 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  45.59 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  47.09 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  44.04 
 
 		 330 aa  263  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  42.99 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  44.97 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  46.01 
 
 		 333 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  41.09 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  37.08 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  36.02 
 
 		 327 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  36.02 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  33.44 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  36.79 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  35.22 
 
 		 328 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  35.24 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  38.15 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  34.78 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  31.27 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.48 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  31.55 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  31.99 
 
 		 297 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  30.45 
 
 		 273 aa  96.7  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 305 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  31.9 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 		 302 aa  87  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  31.37 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  30.12 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  28.48 
 
 		 314 aa  85.9  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  30.88 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.31 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  27.53 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  27.36 
 
 		 642 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.68 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25.81 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25.81 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  25.72 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  27.95 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.16 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  25.81 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  25.95 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.09 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  25.81 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  25.81 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  28.92 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  32.44 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0500  inosine-guanosine kinase  26.21 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  27.3 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2228  inosine kinase  26.79 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216466  hitchhiker  0.00128428 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  25.45 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1317  inosine kinase  29.91 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.110891  normal  0.220477 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  26.39 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  28.63 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>