168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1134 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  100 
 
 		 369 aa  732    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  52.38 
 
 		 386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  51.23 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  51.69 
 
 		 375 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  50.56 
 
 		 390 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  48.89 
 
 		 376 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  54.7 
 
 		 356 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  46.72 
 
 		 375 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  47.89 
 
 		 379 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  48.36 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  45.6 
 
 		 375 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  45.81 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  46.65 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  49.32 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  51.42 
 
 		 367 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  51.7 
 
 		 367 aa  277  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  43.94 
 
 		 367 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  43.71 
 
 		 377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  44.54 
 
 		 357 aa  263  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  41.46 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  42.66 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  39.45 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  45.79 
 
 		 364 aa  255  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  44.9 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  40.55 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  46.43 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  49.44 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  37.5 
 
 		 349 aa  248  8e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  47.88 
 
 		 361 aa  248  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  47.14 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  43.75 
 
 		 353 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  39.34 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  47.35 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  45.61 
 
 		 371 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  43.96 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  43.66 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  39.06 
 
 		 365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  36.75 
 
 		 335 aa  235  9e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  39.63 
 
 		 461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  35.61 
 
 		 335 aa  232  6e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  42.7 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  43.91 
 
 		 339 aa  228  9e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  39.24 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  37.82 
 
 		 449 aa  225  9e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  36.23 
 
 		 323 aa  224  3e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  42.19 
 
 		 324 aa  219  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  42.74 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  28.47 
 
 		 515 aa  173  5e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  33.6 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  35.09 
 
 		 370 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  36.46 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  32.17 
 
 		 386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  28.46 
 
 		 386 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  34.22 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  30.4 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  32.02 
 
 		 394 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  29.65 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  34.39 
 
 		 366 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  31.68 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  29.92 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  32.09 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  32.09 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  31.91 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  30 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  31.13 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  31.91 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  30.29 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  31.44 
 
 		 396 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  30.42 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  29.1 
 
 		 375 aa  119  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  31.97 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  29.97 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  33.96 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  28.34 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  30.09 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  32.43 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  32.43 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  29.7 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  32.8 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  30.38 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  31.89 
 
 		 424 aa  116  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  29.5 
 
 		 400 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  28.07 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  28.95 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  28.65 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  31.25 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  32.82 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  28.07 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  30.46 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  30.81 
 
 		 396 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  29.94 
 
 		 396 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  30.59 
 
 		 385 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  35.94 
 
 		 504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  25.13 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  32.88 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  30.43 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  30.59 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  28.3 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  30.45 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  29.92 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>