More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1082 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 205 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  66.83 
 
 		 213 aa  271  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  53.57 
 
 		 215 aa  203  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  55.21 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  55.21 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  54.4 
 
 		 214 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  53.85 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  56.48 
 
 		 355 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  53.14 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  51.58 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  50.28 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.5 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  48.48 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  40.5 
 
 		 209 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  48.47 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  40.88 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  40.88 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  40.76 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  39.88 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.62 
 
 		 457 aa  122  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.14 
 
 		 209 aa  122  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  40.49 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  38.5 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  33.85 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  39.46 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.98 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  36.14 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  30.26 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  37.7 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.18 
 
 		 217 aa  98.2  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  29.74 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  32.02 
 
 		 245 aa  95.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  31.22 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  37.91 
 
 		 172 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  30.73 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.73 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  30.73 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  30.73 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  30.73 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  30.73 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  29.59 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  34.78 
 
 		 222 aa  92  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  34.59 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  29.56 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  34.59 
 
 		 172 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  31.05 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  33.13 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  29.56 
 
 		 219 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  33.54 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  35.95 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  28.93 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  30.21 
 
 		 219 aa  89  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  33.75 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  26.15 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  32.83 
 
 		 279 aa  88.2  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  36.47 
 
 		 220 aa  88.2  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  28.42 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  32.73 
 
 		 220 aa  87.8  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  32.73 
 
 		 220 aa  87.8  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  32.73 
 
 		 220 aa  87.8  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  28.5 
 
 		 201 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  33.12 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1391  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.42 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  29.17 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  30.3 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  31.25 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  28.28 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  29.32 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  30.91 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  27.75 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  29.32 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  37.93 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  32.3 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  28.32 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  27.51 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  29.06 
 
 		 232 aa  85.1  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  29.9 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  29.32 
 
 		 218 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  35.33 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  32.92 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  39.57 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  31.52 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  33.33 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  31.68 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  31.47 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  24.62 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  27.33 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  31.53 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  30.96 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  31.52 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  25.74 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  29.7 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  27.4 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  30.1 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>