55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1043 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  100 
 
 		 187 aa  370  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  77.71 
 
 		 172 aa  243  8e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  57.46 
 
 		 177 aa  221  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  57.46 
 
 		 177 aa  221  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  58.49 
 
 		 164 aa  174  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  57.14 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  57.14 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  57.14 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  53.9 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  46.82 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  59.38 
 
 		 165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  53.38 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  45.66 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  46.3 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  39.49 
 
 		 301 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  50.65 
 
 		 173 aa  131  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  42.35 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  50.96 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  45.24 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  38.98 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  40 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  44.31 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  45.05 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  40.36 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  40.36 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  38.55 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  39.74 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  39.74 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  41.92 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  37.56 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  45.35 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  36.08 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  36.25 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  35.26 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  33.96 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  38.89 
 
 		 249 aa  94.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  35.22 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  41.25 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  52.27 
 
 		 91 aa  89.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  39.75 
 
 		 165 aa  88.6  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  30.05 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  40.62 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  32.48 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4002  hypothetical protein  29.45 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0771  membrane protein of uknown function UCP014873  32.28 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0847  membrane protein-like  24.84 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1393  hypothetical protein  24.56 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6026  hypothetical protein  24.56 
 
 		 156 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6436  hypothetical protein  24.56 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3602  membrane protein of unknown function UCP014873  26.54 
 
 		 174 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3580  hypothetical protein  29.25 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3068  hypothetical protein  28.87 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0271747  normal  0.467952 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7012  hypothetical protein  23.7 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1377  membrane protein-like  48.65 
 
 		 56 aa  40.8  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>