More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0984 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
403 aa  815    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  30.99 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
399 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3893  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
374 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
385 aa  116  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
369 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
378 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
378 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
374 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
389 aa  106  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
376 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
364 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  33.7 
 
 
399 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  39.43 
 
 
374 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  36.51 
 
 
379 aa  102  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  40.38 
 
 
377 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
394 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.29 
 
 
409 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 
351 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
408 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  28.73 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
355 aa  99.4  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
376 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  32.24 
 
 
935 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  28.41 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
373 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
350 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
374 aa  96.7  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
385 aa  96.7  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
415 aa  96.3  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 
409 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
413 aa  95.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
770 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
374 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  37.95 
 
 
392 aa  94.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
476 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 
390 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  35.41 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  35.41 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 
411 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  31.96 
 
 
389 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  35.41 
 
 
375 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
800 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
384 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
414 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
904 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
410 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
359 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
377 aa  89.7  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.67 
 
 
419 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  33.51 
 
 
377 aa  89.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.78 
 
 
388 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
410 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
382 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  32.26 
 
 
382 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  34.54 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
386 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
356 aa  87.4  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
810 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  29.49 
 
 
351 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  40.58 
 
 
382 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  40.76 
 
 
388 aa  87.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
426 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
392 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
408 aa  86.7  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
366 aa  86.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
399 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  38.51 
 
 
378 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  40.58 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  40.14 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.85 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
507 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  33.64 
 
 
385 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>