More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0946 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  55.38 
 
 		 133 aa  150  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  54.69 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  56.25 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  55.47 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  50.39 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  57.14 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3183  thioredoxin domain protein  50 
 
 		 138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  52.34 
 
 		 131 aa  120  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  49.24 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3525  Thioredoxin domain protein  40.8 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4601  Thioredoxin domain  40.8 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4595  thioredoxin-related  52.71 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  37.61 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  39.6 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1598  hypothetical protein  38.1 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3285  putative thioredoxin  36.69 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  35 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  38.18 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  34.78 
 
 		 406 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  31.91 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  31.68 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  31.63 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  30.56 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  30.56 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  29.17 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  34.62 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  35.96 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  29.79 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  31.07 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  30.1 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  32.18 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  31.82 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  31.82 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  31.82 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  31.82 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  29.41 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  29.21 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  29.41 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  35.44 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  35.44 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  33.66 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  32.95 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  30.93 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  31.82 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  34.67 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  27.84 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  31.11 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  30.69 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  31.31 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  30.34 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  36.36 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  26.92 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  36.36 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  26.92 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  30.21 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  29.41 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  33.33 
 
 		 513 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  29.13 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  31.3 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.78 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  29.13 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  29.7 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  30.61 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  38.36 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  30.68 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  28.7 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  29.13 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  29.59 
 
 		 338 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  34.31 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  32.18 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  35.29 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  24.74 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  27.88 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  28.41 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  26.04 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  32.69 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  24.47 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  27.88 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  30.93 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  28.57 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  26.09 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  31.18 
 
 		 768 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  33.33 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  27.18 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  27.1 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  28.57 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  28.41 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  29.89 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  34.12 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  27.45 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  30.95 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  34.67 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  35.21 
 
 		 368 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  27.88 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  25.96 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  37.5 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>