98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0938 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 132 aa  266  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  54.33 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  55.73 
 
 		 134 aa  147  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  46.96 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  39.13 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  39.13 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  44.09 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  33.62 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  46.59 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  38.3 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  35.19 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 268 aa  57.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  33.77 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  37.21 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  36.67 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 261 aa  53.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  31.18 
 
 		 272 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 276 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  40.26 
 
 		 265 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  36.25 
 
 		 257 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  33.98 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  33.33 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  40.79 
 
 		 252 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  39.47 
 
 		 252 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  34.57 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  33.72 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  30.49 
 
 		 270 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  36.67 
 
 		 269 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  28.38 
 
 		 195 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  30.21 
 
 		 369 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 270 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  36.26 
 
 		 281 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  31.58 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  34.21 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  30.26 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  37.7 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 254 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  30.28 
 
 		 263 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  26.74 
 
 		 270 aa  43.9  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  29.63 
 
 		 263 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 263 aa  43.9  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  32.91 
 
 		 270 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  30 
 
 		 263 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 263 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 263 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  31.51 
 
 		 267 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  23.33 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  34.21 
 
 		 254 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  34.21 
 
 		 254 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  33.66 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3806  regulatory protein LysR  38.33 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  33.66 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0339  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.91 
 
 		 358 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  32.89 
 
 		 114 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 263 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1757  molybdate metabolism transcriptional regulator  40 
 
 		 371 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 254 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.39 
 
 		 263 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  28.26 
 
 		 345 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2967  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  28.57 
 
 		 353 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  32.91 
 
 		 269 aa  40.8  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0222  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  36.67 
 
 		 347 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 254 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  28.21 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3016  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  30.86 
 
 		 370 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  30.69 
 
 		 116 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>